基于高通量测序的青花菜KASP标记开发与应用.docx

基于高通量测序的青花菜KASP标记开发与应用

目录

基于高通量测序的青花菜KASP标记开发与应用（1）．．．．．．．．．．．．．．4

内容概要．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．4

1.1研究背景及意义．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．4

1.2研究目的和任务．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．5

高通量测序技术概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．6

2.1高通量测序技术原理．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．7

2.2高通量测序技术流程．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．8

2.3高通量测序技术应用．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．9

青花菜基因组学研究．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．11

3.1青花菜基因组特点．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．12

3.2青花菜基因组测序进展．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．13

3.3青花菜基因组数据库建立．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．15

KASP标记开发．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．16

4.1KASP标记原理．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．17

4.2KASP标记开发流程．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．18

4.3KASP标记在青花菜中的应用．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．20

基于高通量测序的青花菜KASP标记开发．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．21

5.1序列数据来源与处理．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．22

5.2序列比对与分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．23

5.3KASP标记候选区域筛选．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．25

5.4KASP标记验证与性能评估．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．26

青花菜KASP标记的应用．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．28

6.1品种鉴定与纯度检测．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．29

6.2遗传多样性分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．30

6.3遗传图谱构建与QTL定位．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．30

6.4分子辅助育种．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．32

结果与讨论．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．32

7.1KASP标记开发结果．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．33

7.2KASP标记应用结果．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．34

7.3结果讨论与分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．35

展望与结论．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．36

8.1研究展望．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．37

8.2研究结论．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．38

基于高通量测序的青花菜KASP标记开发与应用（2）．．．．．．．．．．．．．39

内容综述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．39

1.1研究背景及意义．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．40

1.2研究目的和任务．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．41

高通量测序技术概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．