DB13T 2598-2017 花生品种真实性与纯度鉴定 SSR法.docx
ICS67.060
B22
DB13
河北省地方标准
DB13/T2598—2017
花生品种真实性与纯度鉴定SSR法
2017-12-22实施2017-11-22发布
2017-12-22实施
河北省质量技术监督局发布
I
DB13/T2598—2017
前言
本标准按照GB/T1.1-2009给出的规则起草。
本标准由河北农业大学提出。
本标准起草单位:河北农业大学。
本标准主要起草人:杨鑫雷、刘立峰、崔顺立、郭丽果、陈焕英、穆国俊、李洪珍。
DB13/T2598—2017
花生品种真实性与纯度鉴定SSR法
1范围
本标准规定了利用SSR标记对花生品种真实性与纯度进行鉴定的术语和定义、原理、试剂材料、操作程序、数据分析和判定规则。
本标准适用于利用SSR法对花生品种真实性与纯度鉴定的试验过程。
2规范性引用文件
下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,仅注日期的版本适用于本文件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。
GB/T3543.2-1995农作物种子检验规程扦样
GB/T3543.4-1995农作物种子检验规程发芽试验
GB/T6682-2008分析实验室用水规格和试验方法
3术语和定义
下列术语和定义适用于本文件。
3.1
品种真实性(VarietalGenuineness)
供检品种与文件记录(如标签等)是否相符。
3.2
品种纯度(VarietalPurity)
品种在特征特性方面典型一致的程度,用供检样品中本品种的种子数占样品种子总数的百分率表示。
3.3
简单重复序列SSR(SimpleSequenceRepeat)
基因组中以几个核苷酸(一般为2个~6个)为重复单元的长达几十至几百个核苷酸的串联重复序列,又称微卫星标记。
注:由于基本单元重复次数的不同,形成了SSR长度的多态性。
3.4
聚合酶链式反应PCR(PolymeraseChainReaction)
一种用于在体外扩增DNA序列的技术程序。
注:模板DNA经高温变性为单链,在DNA聚合酶和适宜温度下,两条引物分别与DNA模板两条链上的一段互补序列发生退火,并在DNA聚合酶的催化下以四种dNTP(deoxy-ribonucleosidetriphosphate,脱氧核苷三磷酸)为底物,使退火引物延伸从而合成DNA。如此变性退火和合成DNA反复循环,使位于两段已知序列之间的DNA片段呈几何倍数扩增。
工
2
DB13/T2598—2017
3.5
引物Primer
结合在模板DNA上的互补短链,提供3′-OH末端作为DNA合成的起点,延伸合成模板DNA的互补链。
3.6
核心引物CorePrimer
SSR标记分析优先选用多态性高、稳定性好,识别能力强的一套引物的引物。
3.7
标准样品StandardSample
代表已知品种特征特性的育种家种子作为标准样品。
4原理
花生基因组中存在着大量简单重复序列(SSR),由于SSR单元在不同基因型间重复次数不同,因此同一位点的SSR在不同品种间往往具有丰富的长度多态性。利用PCR技术扩增每个位点的简单重复序列,通过电泳分析其长度多态性,达到区别不同花生品种的目的。
5试剂或材料
警示:丙烯酰胺、甲叉双丙烯酰胺具神经毒性,配制时应注意防护。
除非另有说明,使用分析纯试剂和重蒸馏水应符合GB/T6682规定的一级水。
5.1三羟甲基氨基甲烷(Tris):分子式为C?H?NO?,CAS77-86-1。
5.2氯化锂(LiCl):CAS7447-41-8。
5.3乙二胺四乙酸二钠盐(EDTA·Na?):分子式为C??H??N?O?Na?·2H?O,CAS60-00-4。
5.4十二烷基硫酸钠(SDS):分子式为C??H??NaO?S,CAS151-21-3。
5.5聚乙烯吡咯烷酮(PVP):分子式为(C?H?NO)41,CAS9003-39-8。
5.6β-巯基乙醇:分子式为C?H?OS,CAS60-24-2。
5.7酸酚(acidphenolpH4.3)。
5.8异戊醇:分子式为C?H??0,CAS123-51-3。
5.9Tr