铁皮SPL基因家族的鉴定及其表达分析.docx

铁皮SPL基因家族的鉴定及其表达分析

目录

铁皮SPL基因家族的鉴定及其表达分析（1）．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．3

一、内容概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．3

1.1铁皮SPL基因家族的重要性．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．4

1.2研究目的与意义．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．5

二、铁皮SPL基因家族鉴定．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．6

2.1基因序列的获取与分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．7

2.1.1序列来源及筛选．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．11

2.1.2序列分析软件及工具．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．12

2.2基因家族的鉴定与分类．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．13

2.2.1基于序列相似性的鉴定方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．15

2.2.2分类依据及标准．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．15

三、表达分析的前期准备．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．18

3.1实验材料的准备与处理．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．19

3.1.1实验材料的选取原则．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．20

3.1.2材料的处理方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．22

3.2实验试剂与设备的准备．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．22

3.2.1试剂的选购与配置．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．24

3.2.2设备的准备与校准．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．26

四、铁皮SPL基因家族的表达分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．26

4.1表达模式的鉴定．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．27

4.1.1不同组织部位的表达模式．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．28

4.1.2不同发育阶段的表达模式．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．29

4.1.3不同环境条件下的表达模式．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．31

4.2表达量的定量分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．36

铁皮SPL基因家族的鉴定及其表达分析（2）．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．37

一、内容描述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．37

1.1研究背景与意义．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．38

1.2研究目的与内容概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．39

二、铁皮SPL基因家族概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．39

2.1SPL基因的定义与分类．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．40

2.2铁皮SPL基因的特点与功能．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．42

三、铁皮SPL基因家族的鉴定．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．43

3.1基因克隆与序列分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．44

3.2基因结构与进化关系．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．45

3.3特异性保守序列与调控元件分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．46

四、铁皮SPL基因家族的表达分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．47

4.1样品采集与处理．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．50

4.2表达谱构建与可视化．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．52

4.3基因表达差异与生物学意义．．．．．．．．．．．．．