紫薇GASA基因家族鉴定及表达分析.docx

紫薇GASA基因家族鉴定及表达分析

目录

紫薇GASA基因家族鉴定及表达分析（1）．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．4

一、内容描述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．4

1.1紫薇GASA基因家族鉴定及表达分析的研究背景．．．．．．．．．．．．．．．4

1.2研究目的与意义．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．5

1.3相关研究进展概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．6

1.4本章小结．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．7

二、紫薇GASA基因家族的鉴定．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．7

2.1数据来源与处理方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．9

2.2GASA基因家族成员鉴定．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．10

2.3GASA基因家族的保守性分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．12

2.4本章小结．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．13

三、紫薇GASA基因家族的结构特征分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．14

3.1GASA基因家族成员的编码序列分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．14

3.2GASA基因家族成员的启动子分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．15

3.3GASA基因家族成员的外显子-内含子结构分析．．．．．．．．．．．．．．．17

3.4本章小结．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．18

四、紫薇GASA基因家族在不同组织中的表达模式分析．．．．．．．．．．．．19

4.1实验材料与方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．19

4.2表达模式分析方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．21

4.3不同组织中GASA基因家族成员的表达量分析．．．．．．．．．．．．．．．．22

4.4本章小结．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．23

五、紫薇GASA基因家族在特定发育阶段的表达模式分析．．．．．．．．．．23

5.1实验材料与方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．24

5.2发育阶段划分标准．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．26

5.3特定发育阶段中GASA基因家族成员的表达量分析．．．．．．．．．．．．27

5.4本章小结．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．28

六、紫薇GASA基因家族的功能研究．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．29

6.1基因敲除实验设计．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．30

6.2实验结果与讨论．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．31

6.3本章小结．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．32

七、紫薇GASA基因家族的进化分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．33

7.1多序列比对方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．34

7.2非同源序列间的进化分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．35

7.3同源序列间的进化分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．36

7.4本章小结．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．37

八、结论．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．38

8.1研究的主要发现．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．39

8.2研究的创新点．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．40

8.3研究存在的问题及未来展望．．．．．．．．．．．．．．．．．