Vero细胞系转录组学分析及其自噬调控机制研究.docx

Vero细胞系转录组学分析及其自噬调控机制研究

目录

Vero细胞系转录组学分析及其自噬调控机制研究（1）．．．．．．．．．．．．4

一、内容简述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．4

1.1研究背景与意义．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．5

1.2Vero细胞系概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．6

1.3自噬现象简介．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．8

1.4转录组学技术介绍．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．9

1.5研究目的与内容．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．10

1.6研究方法与技术路线．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．12

二、Vero细胞系自噬状态分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．13

2.1实验材料与方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．14

2.1.1细胞培养与处理．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．16

2.1.2自噬活性检测．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．17

2.1.3细胞形态学观察．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．18

2.1.4自噬相关基因表达检测．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．20

2.2结果与分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．21

2.2.1自噬活性变化．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．23

2.2.2细胞形态学特征．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．24

2.2.3自噬相关基因表达水平．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．25

三、Vero细胞系转录组测序与分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．25

3.1转录组测序数据获取．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．28

3.2数据质控与预处理．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．29

3.3转录组差异基因筛选．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．30

3.4差异基因功能注释与富集分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．32

3.5转录组与自噬相关性的分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．33

四、自噬调控相关基因筛选与验证．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．35

4.1自噬相关基因的筛选标准．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．37

4.2关键自噬调控基因的鉴定．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．38

4.3实时荧光定量PCR验证．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．39

五、自噬调控机制探讨．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．40

5.1自噬调控通路分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．41

5.2关键基因在自噬调控中的作用机制．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．44

5.3自噬调控对细胞功能的影响．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．45

六、结论与展望．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．46

6.1研究结论．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．47

6.2研究不足与展望．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．48

Vero细胞系转录组学分析及其自噬调控机制研究（2）．．．．．．．．．．．49

一、内容概要．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．49

（一）背景介绍．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．51

（二）研究意