基于淋巴结转移相关基因的头颈部鳞状细胞癌预后模型构建和肿瘤免疫微环境分析.pdf
CHINARCHOTOLARYNGOLHEADNECKSURG/May2024,Vol.31,No.5287
DOI:10.16066/j.1672-7002.2024.05.004论著
基于淋巴结转移相关基因的头颈部鳞状细胞癌预后模型构建
和肿瘤免疫微环境分析
朱光浩,姚慧,李昊璞,王经杰,朱敏辉,郑宏良
海军军医大学附属长海医院耳鼻咽喉头颈外科,上海200433
TCGAheadandnecksquamouscellcarcinoma
[摘要]目的基于癌症基因组图谱()数据库筛选与头颈部鳞状细胞癌(,
HNSCCRTCGAHNSCC
)淋巴结转移相关的关键基因并构建预后模型。方法利用软件筛选数据库中数据集中肿瘤组
differentiallyexpressedgenesDEGsweightedgene
织和癌旁组织之间的差异表达基因(,),并通过加权基因共表达网络(
co-expressionnetworkanalysisWGCNACoxLasso
,)筛选与淋巴结转移相关的基因模块。使用单变量回归和回归分析构建
ROCCIBERSORT
预后风险模型,通过生存分析和受试者工作特征()曲线验证预后模型的可靠性。最后使用算法分析不
tumormicroenvironmentTME2565DEGsWGCNA
同风险组的肿瘤微环境(,)的差异。结果筛选出个,通过分析得到与
疾病预后和淋巴结转移高度相关的一组基因模块,相关性分析验证该基因模块中的基因表达与淋巴结转移高度相关。通
CoxLasso6CDKN2ACCNE2KNSTRNAURKAKPNA2ORC1
过单因素回归和回归筛选出了个关键预后基因:、、、、和。基于这
6P0.0001ROC
个基因构建预后模型,生存分析显示高风险组的预后显著差于低风险组()。曲线表明该预后模型具有良
CIBE