linux入门及基础操作-美吉生物.pdf

基础命令操作文档 1. 显示用户所在的路径 pwd 2. 创建自己需要的目录 mkdir linux mkdir -p test/test1/test2(创建一系列目录） 3. 删除文件/ 目录 rm -rf test 4. 改变当前目录至指定目录 cd / #进入到根目录 cd /home #进入到home 目录 cd # 回到自己的目录下 cd linux #切换至linux 目录下 5. ，将指定文件/ 目录拷贝到另一文件/ 目录中 cp /home/majorbio3/linux/sequen .txt ./ #将 目录下的sequen .txt 到自己的当前路径下 6. list 的简写，列出目录里的文件和下级目录 ls ls -l ls -a ... 7. ll 即 ls -l ，显示的信息更全(可与ls 的参数同时使用） ll ll -a ... 8. tree 以树状图列出目录下的子目录和文件 9. move，目录/文件的移动和改名，类似于”剪切” mv sequen .txt seq.txt ls 10. Linux 下的一种文本编辑器,vi vi test.txt (创建新的文件test.txt) vi seq.txt （编辑已有的文件seq.txt ） 11. cat 查看或合并文件 cat -n seq.txt(查看文件并显示行号） cat seq.txt test.txt twofile （合并两个文件） 12. more 按屏显示文本文件 ln -s /home/majorbio3/database/16s.silva.fasta #创建文件的软 ，相当于windows 下的快捷方式 more 16s.silva.fasta 13. less 是more 的模拟，用法基本相同 less 16s.silva.fasta less -S 16s.silva.fasta(显示比较长序列的文档） 14. head/tail 只查看文件的开头/最后几行 head -2 16s.silva.fasta tail -3 16s.silva.fasta 15. find 查找文件/ 目录 find ~ -name *fasta(查找户主目录下文件名以fasta 结尾的 文件) 16. 查找文件里与搜索条件匹配的行 grep seq.txt(查找seq.txt 中出现” ”符号的行) grep -c “ ” seq.txt(统计出现” ”符号的个数) 17. 显示文件的行数、字数、字节数 wc -l seq.txt wc -w seq.txt wc seq.txt 18. 重定向 通过在命令间 特定符号来实现 cat seq.txt kk cat seq.txt kk 19. 多个程序可以借助管道符”|”一起运行 less seq.txt | grep | wc 20. d 即在 执行 d 命令 21. top: 动态显示系统进程 ps: 查看用户进程