一种分子动力学仿真测试装置.pdf

分子动力学仿真简介.ppt 分子动力学仿真简介汇报：宋继光2010年4月分子动力学的起源世界上第1例计算机仿真是由Metropolis，Rosenbluth，Teller于1953年在LosAlamos美国国家实验室进行的关于液体的仿真。此后计算机仿真取得了飞速发展。01分子动力学仿真的意义03信息的一般化02可提供大量的精确数据04预测事物发展的趋势细观：10-50μm原子：0.1-5nm宏观：1mm-1cm微观：20-1000nm发展高强度，耐磨，耐热材料。认识规律，指导生产分子动力学仿真的应用领域医药生物新能源机械材料化学分子动力学仿真的基本原理系统模型的建立质点的运动方程分子间的相互势能系统模型的建立选择一个由N

2025-03-25 约1.43千字 26页立即下载

列车防碰撞装置及动力学仿真.pdf 试验研究铁道车辆　第 39 卷第 7 期 200 1 年 7 月文章编号:(2001) 列车防碰撞装置及动力学仿真 李　健, 沈　钢 ( 同济大学机械工程学院, 上海 20033 1) 摘　要: 阐述了防碰撞列车采用能量吸收装置和在车体端部设置变形区域降低碰撞作用力的设计原理。针对国外某防碰撞列车建

2017-05-30 约字 5页立即下载

分子力学和分子动力学总结.ppt Becausesuchsimulationis….给定t时刻的坐标和速度以及其他动力学信息，那么就可计算出t＋Δt时刻的坐标和速度。Δt为时间步长，它与积分方法以及体系有关。如图所示为分子动力学方法信息输入和输出方框图。信息（参数）输入就是要设定表示作用于原子间或分子间相互作用力的势函数，若还要特别考虑热力学平衡状态的性质，则需要设定温度和压力等物理环境条件。在此条件下，由于花很长时间求解多粒子体系的运动方程，从而可以认为在此系统中实现了近于所期望的在热平衡状态下的分布。若此时对得到各时刻的原子位置坐标进行统计计算，则可得到有关的热力学性质（热力学能、比热容等）；而若同时统计处理各时刻的原子位

2025-03-28 约5.65千字 10页立即下载

分子力学和分子动力学.ppt 关于分子力学和分子动力学第1页，共34页，星期日，2025年，2月5日学习目标了解计算化学的主要方法和基本概念能够读懂相关领域的文献，了解常见分子模拟软件及使用掌握基本的计算化学研究思路和方法。了解分子模拟能干什么，我们可以作那些工作，作到什么精度，为在自己的研究领域开展分子模拟方面的研究打一个基础。第2页，共34页，星期日，2025年，2月5日分子模拟的双重性质分子模拟具有理论和实验的双重性质分子模拟不能完全取代实验理论实验模拟理论的正确性模拟参数的正确性模拟方法的选择理论的更新第3页，共34页，星期日，2025年，2月5日系综系综（ensemble）代表一大群相类似的体系的集合。对一类相同

2025-05-10 约6.03千字 34页立即下载

一种钌配合物分子光异构反应动力学特性研究.doc 一种钌配合物分子光异构反应的动力学特性研究【摘要】：金属钌(Ru)的配合物具有丰富的基态和激发态的光物理、光化学性质和氧化还原性质。它在很多研究方面都显示了广阔的应用前景,这些研究方面主要包括：太阳能转化、光催化、非线性光学材料、电化学、电子转移和能量传递、分子识别等。光诱导的异构反应是钌配合物颇具特色的一类光反应,它的变化形式多种多样,反应机理也较为复杂。发生光异构的分子材料在光电子和光子器件技术(包括光开关、数据存储等方面)具有潜在的应用价值。光诱导的异构反应对于光能量转化、信息储存、以及“分子光开关”和“分子马达”的设计均具有重要的意义。本文成功合成并分离得到了一种亚硝酰钌配合物的两种

2017-05-12 约字 3页立即下载

6_分子动力学方法.pdf Molecular Dynamics 分子动力学方法对于一个多粒子体系的物理量的实验观测值可以由总的平均得到。但是由于实验体系非常大，我们不可能计算所有涉及到的态的物理量数值的总平均。按照产生位形变化的方法，我们有两类方法对有限的一系列态的物理量做统计平均：第一类是随机模拟方法（Monte Carlo模拟）体系位形的转变是通过马尔科夫(Markov)过程，由随机性的演化引起的。 分子动力学方法另一类为确定性模拟方法，即分子动力学方法（Molecular Dynamics Method）。该方

2018-05-24 约3.1万字 67页立即下载

《分子动力学》课件.ppt ;引言;分子动力学的基本概念;分子动力学模拟的步骤;分子间力的计算;牛顿运动方程的数值积分;温度和压力的控制;典型的分子动力学算法;周期性边界条件;大规模分子体系的模拟;力场的选择;结构优化与最小化;;热力学性质的分析;;;化学反应的模拟;;蛋白质折叠过程;核酸分子的构象;;;离子通道的动力学;电化学过程的模拟;催化反应的研究;材料性能的预测;纳米材料的设计;;溶剂效应的模拟;;多尺度建模方法;并行计算技术;;分子动力学可视化;数据分析与挖掘;;;;实例分析2:离子通道动力学;实例分析3:新材料设计;;实例分析5:催化反应机理;实例分析6:纳米材料性能;

2025-02-15 约小于1千字 44页立即下载

第6章分子动力学方法.doc 分子动力学方法经典分子动力学方法无疑是材料，尤其是大分子体系和大体系模拟有效的方法之一。分子动力学可以用于NPT，NVE，NVT等不同系综的计算，是一种基于牛顿力学确定论的热力学计算方法。与蒙特卡罗法相比在宏观性质计算上具有更高的准确度和有效性，可以广泛应用于物理，化学，生物，材料，医学等各个领域。本章在介绍分子动力学的基本概念的基础上，简单介绍了分子动力学的基本思想，势函数分类和基本方程。然后介绍了分子动力学的常用系综和典型的NPT，NVE，NVT系综基本方程。结合材料建模中的基本简化方法和技巧，阐述了边界条件和时间积分的数值处理技巧。最后，利用统计力学的基本概念给出分子动力学的计算信息

2016-11-21 约2.08万字 29页立即下载

1分子动力学绪论.pdf 第一章引言 • 分子模拟 (molecular simulation) 根据物理和化学的基本原理, 建立一种以计算数据(由计算机来执行)来代替实验测量的研究方法,获取相关的物理和化学信息. 前辈的忠告-摘自陈敏伯只要是理论科学，都要反复几遍才能得到要领，不

2017-05-18 约5.46万字 50页立即下载

分子动力学简介.pdf 分子动力学模拟：基本原理及应用介绍邵强药物发现与设计中心中科院上海药物所 2015.09.09 ˆ 电子运动方程： (H V ) (R,r ) E 

2019-05-08 约2.5万字 62页立即下载

分子气体动力学.ppt 应用－真空流动 DECADE radiation test facility 应用－材料制备 3M company YBCO experiment: thin film growth 应用－其它 Volcano Prometheus on Jupiter’s moon, Io 应用－飞行器气动性能稀薄气体效应严重影响飞行器的升阻比应用－飞行器气动性能气动布局依然重要 Kn=0.015, Ma=25 M=15, AoA=20? 对于物质运动的描述方法 — 连续的、确定论的方法（连续介质力学） — 离散的、概率论的方法（分子气体动力学）相辅相成，相得益彰总结 Q

2019-01-03 约8.92千字 68页立即下载

分子动力学导论.docx 【专业】计算物理【研究方向】分子动力学模拟【学术讲坛】1、分子动力学简介：分子动力学方法是一种计算机模拟实验方法，是研究凝聚态系统的有力工具。该技术不仅可以得到原子的运动轨迹，还可以观察到原子运动过程中各种微观细节。它是对理论计算与实验的有力补充。广泛应用于材料科学、生物物理与药物设计等。经典MD模拟，其系统规模在一般的计算机上也可达到数万个原子，模拟时间为纳秒量级。2006年进行了三千二百亿个原子的模拟（IBM lueGene/L）。分子动力学总是假定原子的运动服从某种确定的描述，这种描叙可以牛顿方程、拉格朗日方程或哈密顿方程所确定的描述，也就是说原子的运动与确定的轨迹联系在一起。在忽略核子

2017-09-03 约6.19千字 13页立即下载

《F分子动力学》课件.ppt *************************************极化力场1极化效应的重要性传统力场使用固定原子电荷，忽略了分子在电场中的极化响应。这在离子环境、蛋白质活性位点和异相界面等区域引入显著误差。极化力场通过允许电荷分布随环境变化，提高了模拟准确性，特别是对静电主导的过程，如离子选择性、蛋白质-配体结合和隐式溶剂模型。2诱导偶极模型在这种模型中，原子具有极化率，在外电场作用下产生感应偶极矩。偶极矩与电场成正比，但由于偶极间相互作用，需要自洽迭代求解。代表性力场包括AMOEBA，它结合了多极矩展开和诱导偶极，精确描述分子电荷分布。计算成本相对较高，但物理描述更准确。3Drude

2025-04-08 约2.34万字 60页立即下载

《分子动力学》课件.ppt 分子动力学基础与应用分子动力学是一种强大的计算机模拟方法，通过研究原子和分子的物理运动，帮助我们深入理解物质在微观层面的行为规律。本课程将系统介绍分子动力学的基本概念、理论基础、计算方法以及在科学研究中的广泛应用。通过学习，您将掌握分子动力学模拟的核心原理，了解如何构建分子系统模型，选择适当的势函数，应用正确的积分算法，并对模拟结果进行科学分析。我们也将探讨分子动力学在材料科学、生物化学和药物研发等领域的前沿应用。 分子动力学的历史发展1950年代初期理论基础的奠定，物理学家开始探索利用计算机模拟分子运动的可能性1957年Alder和Wainwright发表首个硬球体系的分子动力学模拟研究19

2025-04-12 约4.13千字 14页立即下载

分子动力学课件.pdf 经典分子动力学方法中国科学院固体物理研究所计算材料科学研究室范巍 分子动力学基本原理 • 一个体系有N个原子 • 体系的状态由这N个原子的位置{r}和动量{p } i i 或速度{vi}来标志。 •

2017-09-14 约3.39万字 37页立即下载