第3章-2D构型图chemdraw4研究.ppt

第三章 ChemDraw化学作图软件 1、软件介绍 ChemDraw是ChemOffice中使用最为频繁的组件，是国际上绝大多数杂志指定的论文排版软件，为不同的杂志备有不同的模板，应用最为广泛。 其理念是“化学家能懂的，ChemDraw也应该懂”。 例子 ChemDraw 练习 1 ChemDraw 练习 1 ChemDraw 练习 2 可通过按住Shift键不放一次选择多个目标 注意并不是矩形框内的对象均被选中，只有用黑方块标识的对象才为所选对象 放大、缩小操作 通过调整矩形框四周选择区域进行目标放大、缩小、拉伸以及压缩等操作 旋转操作 从Object菜单中有关选择的选项来控制旋转角度，或者直接通过选择区域的旋转光标块进行旋转 旋转控制光标块 对象属性编辑操作 选择对象后，点击鼠标右键来修改对象属性 原 子 属 性 控 制 编辑原子标识 修改原子性质 显示原子编号 原子电荷 自由基标识 化 学 键 属 性 控 制 单、双、三、四重键 键的位置 键的拓扑结构(环/链) 可对键的属性(粗细、长短进行修改) 键的颜色 其中单键的属性有： 总共包括如下化学键： 分 子 属 性 控 制 包括旋转、原子和键属性、文本属性、背景边框或括号、性质分析以及整合等 (3) 简单分子结构的绘制 丹参醌 绘制过程： 选择合适模板，建立构型框架 利用化学键选择按钮增加侧链取代基 说明： 在默认情况下，键长是固定的，不能通过拖动来调整新加的键的长度，此时可将Object菜单中的Fixed Lengths未选后，可拉长或缩短新加的化学键 在绘制构型过程中，程序自动检查构型的合理性，并将有可能出现问题的地方用红色圈出 该C原子配位数过高 选择化学键，修改键的类型 说明： 选择所要修改的键，然后点击鼠标右键进行修改 对于单键修改为双键，最简便方法是选择实单键工具按钮后单击所要修改的单键即可 该方法适用于其它类型化学键的修改 例如： 对于双键的修改也可用类似的方法获得不同表示方式的双键： 选择原子，修改原子类型 说明： 修改原子类型的方法有三种： (a) 选择原子后点击右键，选择Edit Label选项 (b)直接用文本按钮选择后进行修改 (c)选择各种化学键(单、双键等均可)按钮后双击所要修改的原子 选择整个分子，旋转使之处于合适角度 作进一步处理，包括显示原子编号，加背景框 鼠标右键，修改分子属性 画烷烃、烯烃、炔烃 画芳烃、酚、醇等 丹参醌 2mol 1mol ChemDraw是美国Cambridge (剑桥)软件公司出品的商业软件Chemoffice中的一个组成模块。功能有：分子命名及自动产生结构、可以预测所绘制分子的NMR图谱、物理化学性质以及绘制试验仪器装置图等。 版本：Ultra 10.0(附带在ChemOffice 2006)，可到下载试用版本 2. 软件主要使用方法 (1) 操作界面 菜单栏说明 文件菜单：用于文件操作和打印等(扩展名为cdx) 默认操作选项设置 文档设置 部分国外化学刊物默认文档设置，包括ACS、RSC等出版社 文 档 设 置 包括页面、页眉/页脚、绘图默认参数、文档标题、原子标记字体以及背景和前景色等设置 默认操作选项设置 包括模型构造/显示、警告信息、默认文件打开和存储等选项 编辑菜单：构型复制和粘贴操作(提供与WORD等其他程序接口) Word, PowerPoint文档中 产生3D构型图 产生3D构型图 显示菜单：用于控制工具条以及窗口的显示/隐藏 依次为： 分析、化学性质、作图信息、周期表以及字符表窗口 页面视图的控制(放大/缩小等) 控制警告信息的显示 控制标尺显示等 分析窗口 化学性质窗口 包括对分子的沸点、熔点、临界温度、临界压力、临界体积以及Gibbs自由能等热力学参数的预测 元素周期表窗口 包括元素的原子量、同位素丰度、熔点、沸点、电负性、电离势以及原子半径等信息 字符表窗口 用于特殊字符的输入 对象菜单：用于各种对象的设置、位置安排以及旋转等 固定键长键角 (有时需取消) 对象定位(用于表格) 设置背景框 对多个对象进行整合，以及设定键的连接点 当多个对象发生重叠时，控制它们的前后关系 包括水平、垂直翻转、不同角度旋转等 构型菜单：用于设置原子、键属性、构型检查、特殊构型产生方法、反应分析以及NMR预测和构型的命名等 预测H和C的NMR 定义昵称、通过化合物名字自动生成构型以及对构型的自动命名 构型检查和调整 构造构型特殊方法 1HNMR预测结果 预测精度 对应的NMR谱图(并可确定出各峰的来源) 构型的自动命名 由化合物名字自动生成构型 文字菜单：控制字体、字符大小、上下标以及文本位置以及行间距等 曲线绘制菜单：包括线型、箭头控制以及区域填空等 表示有更多可