一种基于半自动结构库的多域蛋白质同源结构查找方法.pdf

基于聚类技术的蛋白质同源性分析规划.doc 渤海大学基于聚类技术的蛋白质同源性分析规划专业：计算机科学与技术（软件开发）年班级：11级9班小组成员：陈静欢刘礼越王晨吴雪键岳政燃赵胜超指导教师：赵连鹏 1.1研究问题（1）实验材料来源问题（2）如何提取pdb文件中氨基酸序列（3）如何将提取出来的氨基酸序列复制到新建的txt文件中（4）如何调用txt文件中已经提取出来的氨基酸序列（5）如何将氨基酸序列三个字符变成一个（6）序列比对问题 1.2研究背景 蛋白质结构决定蛋白质功能。随着各种基因组计划的完成，产生了海量的蛋白质序列数据，通过传统试验的方法已经无法对这些数据进行及时的

2017-08-14 约7.65千字 11页立即下载

一种基于循环网络的蛋白质与蛋白质相互作用预测方法.pdf (19)中华人民共和国国家知识产权局 (12)发明专利申请 (10)申请公布号 CN 112837742 A (43)申请公布日 2021.05.25 (21)申请号 202110086831.5 (22)申请日 2021.01.22 (71)申请人浙江

2023-06-03 约2.27万字 10页立即下载

一种基于萤火虫算法的蛋白质结构预测从头方法[发明专利].docx PAGE 1- 一种基于萤火虫算法的蛋白质结构预测从头方法[发明专利] 一、引言 (1)蛋白质结构预测作为生命科学领域的重要研究方向，对于理解蛋白质的功能和调控机制具有重要意义。随着生物信息学技术的不断发展，蛋白质结构预测方法的研究日益深入。在众多预测方法中，从头预测方法因其无需依赖已知蛋白质结构信息，在理论上有广泛的应用前景。 (2)然而，蛋白质结构的复杂性决定了从头预测的难度。传统的从头预测方法大多基于物理化学原理，但由于蛋白质结构的多样性和复杂性，这些方法在实际应用中往往存在预测精度较低、计算效率不高的问题。近年来，基于人工智能的预测方法逐渐成为研究热点，其中萤火虫算法作为一种新型智能优

2025-01-21 约1.6千字 3页立即下载

一种基于循环神经网络的蛋白质二级结构预测方法.pdf (19)中华人民共和国国家知识产权局 (12)发明专利申请 (10)申请公布号 CN 112837741 A (43)申请公布日 2021.05.25 (21)申请号 202110097155.1 (22)申请日 2021.01.25 (71)申请人浙江工业大学地址

2023-06-02 约1.12万字 9页立即下载

一种基于残基距离增强搜索的蛋白质结构预测方法.pdf (19)中华人民共和国国家知识产权局 (12)发明专利申请 (10)申请公布号 CN 113380319 A (43)申请公布日 2021.09.10 (21)申请号 202110433816.3 (22)申请日 2021.04.21 (71)申请人浙江工业大学地址

2023-06-19 约1.38万字 9页立即下载

基于直接法的蛋白质结构解析方法研究.docx 基于直接法的蛋白质结构解析方法研究一、引言 蛋白质是生命体内最重要的生物大分子之一，具有丰富的结构和功能多样性。蛋白质的结构解析对于理解其功能和参与的生物过程具有重要意义。在蛋白质结构解析的方法中，直接法因其高效、准确的特点而备受关注。本文旨在介绍基于直接法的蛋白质结构解析方法的研究现状及进展。二、蛋白质结构解析的重要性 蛋白质结构解析是生物信息学、结构生物学、药物设计等领域的重要研究内容。通过解析蛋白质的结构，可以了解其功能、相互作用以及参与的生物过程，为疾病的治疗和药物的研发提供重要依据。传统的蛋白质结构解析方法主要包括X射线晶体学、核磁共振等，但这些方法在处理某些复杂或大分子量的蛋白

2025-02-16 约4.19千字 9页立即下载

一种基于蛋白质序列比对的分子虚拟筛选方法.pdf (19)中华人民共和国国家知识产权局 (12)发明专利申请 (10)申请公布号 CN 112820355 A (43)申请公布日 2021.05.18 (21)申请号 202011483191.3 (22)申请日 2020.12.16 (71)申请人浙江工业大学地址

2023-06-02 约1.89万字 12页立即下载

蛋白质结构的研究方法.解读.ppt 12 蛋白质结构的研究方法 蛋白质的结构分级 12.1 一级结构的测定 Edman降解法质谱法由DNA序列推导蛋白质序列 Edman降解法 蛋白质测序技术最具有意义的发展是瑞典化学家Edman发展的以他名字命名的蛋白质N-端测序方法——Edman降解法。 Edman降解进行多肽序列分析是一个循环式的化学反应过程，如左图所示循环过程包括三个主要的化学步骤偶联裂解转化偶联试剂——异硫氰酸苯酯即Edman试剂多肽链的自由α-氨基与耦联试剂PITC（异硫氰酸苯酯）反应后，与紧邻的第二个残基的结合力大大减弱，易于断裂。无水强酸如TFA（三氟乙酸）使第一

2016-11-02 约1.98万字 152页立即下载

蛋白质结构预测的原理与方法.ppt *二、蛋白质二级结构预测的意义蛋白质二级结构预测不仅仅可以给出二级结构信息，在实际工作中有广泛的用途。①由蛋白质二级结构统计分析得到的规则可用于全新蛋白质设计或蛋白质突变体的设计。②当序列同源性较低时，二级结构的指认有助于确定蛋白质间结构与功能的关系。③在同源蛋白质模建中，二级结构预测有助于建立正确的序列比对关系。④在基于二级结构片段堆积的三级结构预测中正确的二级结构预测是第一步。⑤二级结构的预测有助于多维核磁共振中二级结构的指认，同时也有助于晶体结构的解析。第31页，讲稿共79页，2023年5月2日，星期三*三、蛋白质二级结构预测的主要方法二级结构预测的方法大体分为三代：第一代是基于单个氨基

2024-01-13 约8.44千字 79页立即下载

蛋白质结构测定的方法.ppt 关于蛋白质结构测定的方法第1页，讲稿共26页，2023年5月2日，星期三第2页，讲稿共26页，2023年5月2日，星期三蛋白质空间结构国内外研究动态在国际上,美国首先提出大规模测定蛋白质结构的计划,现在已经进入第二期的产出阶段.其他发达国家(欧盟和日本)也相继启动自己的结构基因组计划.我国根据美国第一期的试验计划,发现X射线晶体学仍然是测定结构的主要手段,这与预期的结果相符.过去和现在情况都是这样,蛋白质结构数据库中的80%的结构来自X射线衍射.其他有重要贡献的手段有核磁共振和低温冷冻电镜(cryo2EM).由于这三种方法的重要性,最近几年,它们都有很大的改进.理论方法的进展也非常快,与实验的

2024-01-16 约5.12千字 26页立即下载

蛋白质结构测定的方法.ppt 感谢大家观看第26页,共26页，2024年2月25日，星期天关于蛋白质结构测定的方法第2页,共26页，2024年2月25日，星期天蛋白质空间结构国内外研究动态在国际上,美国首先提出大规模测定蛋白质结构的计划,现在已经进入第二期的产出阶段.其他发达国家(欧盟和日本)也相继启动自己的结构基因组计划.我国根据美国第一期的试验计划,发现X射线晶体学仍然是测定结构的主要手段,这与预期的结果相符.过去和现在情况都是这样,蛋白质结构数据库中的80%的结构来自X射线衍射.其他有重要贡献的手段有核磁共振和低温冷冻电镜(cryo2EM).由于这三种方法的重要性,最近几年,它们都有很大的改进.理论方法的进展也非常快

2024-04-05 约6.6千字 26页立即下载

蛋白质结构优化方法和装置.pdf (19)国家知识产权局 (12)发明专利申请 (10)申请公布号 CN 116092576 A (43)申请公布日 2023.05.09 (21)申请号 202111295687.2 (22)申请日 2021.11.03 (71)申请人北京深势科技有限公司地址 10

2023-05-07 约1.22万字 12页立即下载

蛋白质结构测定的方法.ppt 关于蛋白质结构测定的方法第1页，共26页，星期日，2025年，2月5日第2页，共26页，星期日，2025年，2月5日蛋白质空间结构国内外研究动态在国际上,美国首先提出大规模测定蛋白质结构的计划,现在已经进入第二期的产出阶段.其他发达国家(欧盟和日本)也相继启动自己的结构基因组计划.我国根据美国第一期的试验计划,发现X射线晶体学仍然是测定结构的主要手段,这与预期的结果相符.过去和现在情况都是这样,蛋白质结构数据库中的80%的结构来自X射线衍射.其他有重要贡献的手段有核磁共振和低温冷冻电镜(cryo2EM).由于这三种方法的重要性,最近几年,它们都有很大的改进.理论方法的进展也非常快,与实验的结合

2025-04-03 约5.1千字 26页立即下载

蛋白质结构预测的原理与方法.ppt 蛋白质序列：二级结构：蛋白质二级结构预测是蛋白质结构预测的主要组成部分之一。第31页，共78页，星期日，2025年，2月5日一、蛋白质二级结构预测概述蛋白质的二级结构预测的基本依据是：每一段相邻的氨基酸残基具有形成一定二级结构的倾向。二级结构预测问题是模式分类问题二级结构预测的目标：判断每一段中心的残基是否处于?螺旋、?折叠、转角（或其它状态）之一的二级结构态，即三态。第32页，共78页，星期日，2025年，2月5日基本策略（1）相似序列→相似结构QLMGERIRARRKKLKQLMGAERIRARRKKLK第33页，共78页，星期日，2025年，2月5日二、蛋白质二级结构预测的意义蛋白质

2025-05-02 约8.24千字 78页立即下载

蛋白质2蛋白质结构.ppt 2.1 蛋白质的概念、重要性及分类 2.2 氨基酸 2.3 蛋白质的结构 2.4 蛋白质的结构和功能的关系 2.5 蛋白质的性质 2.6 蛋白质的提取、分离和纯化 蛋白质结构的层次肽平面一级结构二级结构三级结构 蛋白质变性与复性超二级结构和结构域四级结构构象（conformation）：是分子中的原子的空间排列，原子的空间排列取决于它们的绕键旋转。构象的改变并不改变其共价键结构（原子只在单链周围旋转）。例如:酶与底物，抗体与抗原，生物的受体与配体的相互作用，往往涉及酶、抗体、受体等蛋白质的构象改变。除一级结构外，蛋白质的二级、

2017-05-22 约9.9千字 104页立即下载