一种基于残基距离增强搜索的蛋白质结构预测方法.pdf

基于深度学习的蛋白质-RNA结合残基预测方法研究.pdf 摘要 蛋白质-RNA相互作用是细胞内许多生物学过程的关键组成部分，包括转录、翻译、修饰和转运等。这种相互作用在细胞内的调控和功能执行中起着至关重要的作用，因此对其进行深入研究具有重要意义。在蛋白质和RNA之间的相互作用界面上，存在部分对于结合自由能变化起关键作用的氨基酸残基，通过与RNA分子的特定区域相互作用，促进或稳定蛋白质与RNA的结合，这部分残基被称为结合残基。因此，对结合残基的研究和分析在

2025-04-07 约7.58万字 52页立即下载

基于序列特征的蛋白质残基接触预测：方法探索与实践.docx 基于序列特征的蛋白质残基接触预测：方法探索与实践一、引言 1.1研究背景与意义 蛋白质作为生命活动的主要承担者，在生物体的各项生理过程中扮演着不可或缺的角色。从构成细胞和生命体的基本结构，到参与物质运输、催化化学反应、信息交流以及免疫防御等重要活动，蛋白质的功能多样性使其成为生命科学研究的核心对象之一。例如，血红蛋白负责运输氧气，酶参与生物体内的各种化学反应，抗体在免疫系统中抵御病原体的入侵。可以说，没有蛋白质，生命活动将无法正常进行。 蛋白质的功能与其三维结构密切相关，而蛋白质残基间的接触在决定蛋白质三维结构中起着关键作用。残基接触是指蛋白质中两个氨基酸残基在三维空间中距离足够近，它们之

2025-04-26 约2.01万字 16页立即下载

一种基于循环网络的蛋白质与蛋白质相互作用预测方法.pdf (19)中华人民共和国国家知识产权局 (12)发明专利申请 (10)申请公布号 CN 112837742 A (43)申请公布日 2021.05.25 (21)申请号 202110086831.5 (22)申请日 2021.01.22 (71)申请人浙江

2023-06-03 约2.27万字 10页立即下载

基于数据挖掘的蛋白质作用热点残基预测及作用界面研究的中期报告.docx 基于数据挖掘的蛋白质作用热点残基预测及作用界面研究的中期报告一、项目背景及研究问题 蛋白质是生命体中一类重要的生物大分子。其具有结构多样性和生物活性，广泛参与到生命体的各种生理和代谢过程中。蛋白质之间的相互作用及其作用界面的研究对于我们深入理解蛋白质的生物功能以及疾病的发生机理具有重要的现实意义。本项目的研究问题主要包括以下几个方面： 1. 如何利用现有的蛋白质序列和结构数据，预测蛋白质序列中的作用热点残基，即对蛋白质相互作用产生重要贡献的氨基酸残基。 2. 如何利用现有的蛋白质相互作用的结构数据，分析作用界面的组成和特点，并提取生物学意义。 3. 如何将现有的蛋白质相互作用数据，建立一个

2023-09-03 约小于1千字 2页立即下载

一种基于萤火虫算法的蛋白质结构预测从头方法[发明专利].docx PAGE 1- 一种基于萤火虫算法的蛋白质结构预测从头方法[发明专利] 一、引言 (1)蛋白质结构预测作为生命科学领域的重要研究方向，对于理解蛋白质的功能和调控机制具有重要意义。随着生物信息学技术的不断发展，蛋白质结构预测方法的研究日益深入。在众多预测方法中，从头预测方法因其无需依赖已知蛋白质结构信息，在理论上有广泛的应用前景。 (2)然而，蛋白质结构的复杂性决定了从头预测的难度。传统的从头预测方法大多基于物理化学原理，但由于蛋白质结构的多样性和复杂性，这些方法在实际应用中往往存在预测精度较低、计算效率不高的问题。近年来，基于人工智能的预测方法逐渐成为研究热点，其中萤火虫算法作为一种新型智能优

2025-01-21 约1.6千字 3页立即下载

一种基于循环神经网络的蛋白质二级结构预测方法.pdf (19)中华人民共和国国家知识产权局 (12)发明专利申请 (10)申请公布号 CN 112837741 A (43)申请公布日 2021.05.25 (21)申请号 202110097155.1 (22)申请日 2021.01.25 (71)申请人浙江工业大学地址

2023-06-02 约1.12万字 9页立即下载

蛋白质结构预测的原理与方法.ppt *二、蛋白质二级结构预测的意义蛋白质二级结构预测不仅仅可以给出二级结构信息，在实际工作中有广泛的用途。①由蛋白质二级结构统计分析得到的规则可用于全新蛋白质设计或蛋白质突变体的设计。②当序列同源性较低时，二级结构的指认有助于确定蛋白质间结构与功能的关系。③在同源蛋白质模建中，二级结构预测有助于建立正确的序列比对关系。④在基于二级结构片段堆积的三级结构预测中正确的二级结构预测是第一步。⑤二级结构的预测有助于多维核磁共振中二级结构的指认，同时也有助于晶体结构的解析。第31页，讲稿共79页，2023年5月2日，星期三*三、蛋白质二级结构预测的主要方法二级结构预测的方法大体分为三代：第一代是基于单个氨基

2024-01-13 约8.44千字 79页立即下载

蛋白质结构预测的原理与方法.ppt 蛋白质序列：二级结构：蛋白质二级结构预测是蛋白质结构预测的主要组成部分之一。第31页，共78页，星期日，2025年，2月5日一、蛋白质二级结构预测概述蛋白质的二级结构预测的基本依据是：每一段相邻的氨基酸残基具有形成一定二级结构的倾向。二级结构预测问题是模式分类问题二级结构预测的目标：判断每一段中心的残基是否处于?螺旋、?折叠、转角（或其它状态）之一的二级结构态，即三态。第32页，共78页，星期日，2025年，2月5日基本策略（1）相似序列→相似结构QLMGERIRARRKKLKQLMGAERIRARRKKLK第33页，共78页，星期日，2025年，2月5日二、蛋白质二级结构预测的意义蛋白质

2025-05-02 约8.24千字 78页立即下载

基于特征组合与智能搜索的蛋白质适应度预测方法及系统.pdf (19)国家知识产权局 (12)发明专利申请 (10)申请公布号CN117423384A (43)申请公布日2024.01.19 (21)申请号202311516469.6G06F18/211(2023.01)

2024-01-18 约2.33万字 23页立即下载

一种基于进化搜索的蛋白质构象空间优化方法.pdf (19)中华人民共和国国家知识产权局 (12)发明专利申请 (10)申请公布号 CN 112967751 A (43)申请公布日 2021.06.15 (21)申请号 202110299297.6 (22)申请日 2021.03.21 (71)申请人湖南大学地址 41

2023-06-10 约7.7千字 6页立即下载

一种基于结构特征的DNA绑定残基预测方法.pdf (19)中华人民共和国国家知识产权局 (12)发明专利申请 (10)申请公布号 CN 112837740 A (43)申请公布日 2021.05.25 (21)申请号 202110081107.3 (22)申请日 2021.01.21 (71)申请人浙江

2023-06-06 约9.98千字 9页立即下载

一种基于小生境局部增强的蛋白质构象采样方法.pdf (19)中华人民共和国国家知识产权局 (12)发明专利申请 (10)申请公布号 CN 113362887 A (43)申请公布日 2021.09.07 (21)申请号 202110489364.0 (22)申请日 2021.05.06 (71)申请人浙江工业大学地址

2023-06-18 约1.74万字 10页立即下载

一种基于多任务时域卷积神经网络的蛋白质结构预测方法及装置[发明专.docx PAGE 1- 一种基于多任务时域卷积神经网络的蛋白质结构预测方法及装置[发明专第一章蛋白质结构预测背景与意义 (1)蛋白质是生命活动的基础，其结构和功能决定了生物体的各种生物学过程。蛋白质结构的预测对于理解蛋白质的功能、设计药物、研究疾病机理等领域具有重要意义。传统的蛋白质结构预测方法主要依赖于实验手段，如X射线晶体学、核磁共振等，但这些方法耗时耗力，成本高昂，且无法预测大量蛋白质的三维结构。随着计算机技术的飞速发展，蛋白质结构预测成为了计算机科学和生物信息学交叉领域的研究热点。 (2)近年来，深度学习技术在蛋白质结构预测领域取得了显著进展。卷积神经网络（CNN）作为一种强大的特征提取工具

2025-01-18 约2.23千字 5页立即下载

六蛋白质结构预测.pptx 1;2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12;13;14;15;16;17;18;19;20;21;22;23;24;25;26;27;28;29;30;31;32;33;34;35;36;37;38;39

2020-02-25 约小于1千字 39页立即下载

蛋白质结构预测.ppt 第四节蛋白质结构预测中的主要生物信息资源一、常用蛋白质序列数据库1、PIR数据库（Proteininformationresource）2、SWISS-PROT数据库3、TrEMBL数据库4、UniProt蛋白质数据仓库二、常见蛋白质结构数据库1、蛋白质结构数据库—PDB（Proteindatabank）2、蛋白质结构分类数据库（SCOP和CATH）第31页，共56页，星期日，2025年，2月5日蛋白序列数据库种类繁多，各有特色。根据实际情况，通常结合几个不同数据库对结果进行比较以下介绍3种数据库1、PIR数据库（Proteininformationresource）网址：http://www

2025-04-16 约8.99千字 56页立即下载