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linux 安装 lammps.doc

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方法一: 【原创】Linux下安装单机多核并行lammps(附meam包)(2010-12-08 08:45:50)转载▼标签: lammps并行安装meam 分类: 计算材料 总结:Linux下安装单机并行lammps ○.机器配置: 1.处理器:Intel XEON × 2 2.主板:Intel S5500BC 3.内存:金士顿4G × 6 4.操作系统:Redhat Enterprise 5.3 x86_64 一.下载需要的源文件 fftw-2.1.5.tar.gz 下载地址:/download.html mpich2-1.0.2p1.tar.gz 下载地址:/pub/mpi/old/ lammps-1Dec10.tar.gz 下载地址:/tars/ 并以root身份(以下均在root下)拷贝到 /usr/local/src目录下 二.安装FFTW # tar xvzf fftw-2.1.5.tar.gz # cd fftw-2.1.5 # ./configure --prefix=/opt/mathlib/fftw215-gnu --enable-float # make # make install 三.安装MPICH2 # tar xvzf mpich2-1.0.2p1.tar.gz # cd mpich2-1.0.2p1 # ./configure --prefix= /opt/mpich2-gnu # make # make install 如果不出错,应该就是安装成功了。接下来的工作时进行配置。 MPI应用一个管理器来管理运行MPI程序,这个管理器就是mpd,但是在正式开始运行mpd前还需要一个基于安全考虑的配置文件.mpd.conf,这个文件是要放在运行程序的用户的home目录下,本例子中就是/home/mpi/.mpd.conf,而且这个文件只能由这个用户读写,创建文件的命令是, # cd $HOME # touch .mpd.conf # chmod 600 .mpd.conf 什么意思,我暂时也不太清楚,但是就这么做就可以了。 可参考:/s/blog_5f3365780100ojki.html 四.安装lammps,附带meam包 # tar xvzf lammps-1Dec10.tar.gz # cd lammps-1Dec10/cd lib/meam/ # make -f Makefile.gfortran (intall meam, you can also choose other versions) # cd ../src/MAKE # vim Makefile.g++ (edit the Makefile) ***********************************Makefile.g++ beginn********************************** (说明:红色字表示改动或添加的部分) # g++ = RedHat Linux box, g++4, gfortran, MPICH2, FFTW SHELL = /bin/sh # --------------------------------------------------------------------- # compiler/linker settings # specify flags and libraries needed for your compiler CC = g++ CCFLAGS = -g -O -DFFT_FFTW -DLAMMPS_GZIP -DMPICH_IGNORE_CXX_SEEK -I/opt/mathlib/fftw215-gnu/include -I/opt/mpich2-gnu/include -I../../lib/meam DEPFLAGS = -M LINK = g++ LINKFLAGS = -g -O -L/opt/mathlib/fftw215-gnu/lib -L/opt/mpich2-gnu/lib -L../../lib/meam LIB = ARCHIVE = ar ARFLAGS = -rc SIZE = size # ------------------------------
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