单细胞测序技术在辅助生殖中应用.pdf

高通量测序技术发展 高通量测序技术成本 单细胞测序在精准医疗上的意义 对于大多数高通量测序，结果只是一群细胞中信号的平均值，或者只代表 其中占优势数量的细胞信息，无法反映每个细胞的基因组信息，无法反映 基因组的动态改变 细胞异质性：癌症细胞、神经元细胞、生殖细胞 样本稀少：循环肿瘤细胞、胚胎细胞 单细胞测序技术成果 2011年，《Nature Methods》将单细胞研究方法列为未来几年最值得关注 的技术领域之一 2013年，《Science》将单细胞测序列为年度最值得关注的六大领域榜首 2013年，《Nature Methods 》将单细胞测序列为年度最重要的方法学进展 单细胞测序技术难点 WGA NGS 2015‐12‐10 全基因组扩增技术（WGA） 扩增成功率：直接影响检测的成功率 扩增均匀性：影响CNV检测准确性 扩增覆盖度：影响SNV检测种类 等位基因脱口率（ADO rate）：影响SNV检测准确性 2015‐12‐10 DOP-PCR PCR指数扩增 扩增较均匀 扩增偏倚性高 覆盖度低 2015‐12‐10 MDA MDA比DOP-PCR 覆盖度高 仍是一种指数扩增 存在扩增偏倚性 扩增不均匀 2015‐12‐10 MALBAC MALBAC是一种线性扩增 降低了扩增偏倚性 覆盖度提高 等位基因脱扣率降低 2015‐12‐10 均一性比较 2015‐12‐10 Lei Huang, et al. Annu Rev Genomics Hum Genet. 2015 ADO rate 2015‐12‐10 Lei Huang, et al. Annu Rev Genomics Hum Genet. 201