EMS化学诱变大豆叶片早衰突变体转录组学研究.docx

EMS化学诱变大豆叶片早衰突变体转录组学研究

目录

EMS化学诱变大豆叶片早衰突变体转录组学研究（1）．．．．．．．．．．．．．4

一、内容简述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．4

研究背景及意义．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．5

1.1大豆叶片早衰研究现状．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．6

1.2EMS化学诱变技术概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．7

1.3转录组学在研究突变体中的应用．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．8

研究目的与任务．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．9

2.1明确EMS化学诱变大豆叶片早衰突变体的转录组变化．．．．．．．．．．9

2.2探究叶片早衰的分子机制．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．10

2.3为大豆遗传改良提供理论依据．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．11

二、材料与方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．13

实验材料．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．15

1.1EMS化学诱变大豆突变体．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．15

1.2野生型大豆对照．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．17

实验方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．17

2.1叶片采集与处理．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．18

2.2转录组测序及数据分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．19

2.3实时荧光定量PCR验证．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．20

三、结果与分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．21

测序数据概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．22

1.1测序数据质量及数量统计．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．24

1.2数据处理流程．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．25

基因突变分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．25

2.1突变位点类型及分布．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．26

2.2关键基因突变情况分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．26

差异表达基因分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．28

3.1差异表达基因筛选标准．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．30

3.2差异表达基因数量及聚类分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．31

3.3差异表达基因功能注释及分类．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．32

四、讨论．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．32

EMS化学诱变大豆叶片早衰突变体转录组变化特点．．．．．．．．．．．．33

叶片早衰相关基因的功能及调控网络分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．35

本研究与其他研究结果的对比与讨论．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．37

五、结论与展望．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．38

EMS化学诱变大豆叶片早衰突变体转录组学研究（2）．．．．．．．．．．．．39

内容描述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．39

1.1研究背景．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．40

1.2研究目的．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．40

1.3研究方法概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．