黄单胞菌xanthomonascampestrispvraphani-华中农业大学学报.pdf

第 卷 第 期 华 中 农 业 大 学 学 报 ３５ ４ 　 　 　 　 　 　 　 Vol．３５　No．４ 年 月 , ２０１６ 　７ JournalofHuazhon A riculturalUniversit Jul２０１６４２~４８ g g y y 黄单胞菌Xanthomonas campestris pv. raphani 756C 中 型分泌蛋白的生物信息学分析 Ⅵ １ ２ 韩长志 王 娟 　 　 / , ; 西南林业大学林学院 云南省森林灾害预警与控制重点实验室 昆明 １． ６５０２２４ / / 云南省林业科学院 国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室 ２． , 云南省森林植物培育与开发利用重点实验室 昆明 ６５０２０１ 摘要 为明确黄单胞菌 ( )中存在的 型分泌蛋白( )数 　 Xanthomonascam estris v．rahani７５６CXcr Ⅵ Tss p p p 、 , 量及其所具有的信号肽 保守 motif等信息以及该菌中Tss与其他病菌中同源序列之间的遗传关系 利用关键 , 、 ( ) 词对 蛋白质数据库进行搜索 并对 中 氨基酸序列开展信号肽 跨膜结构域以及保守基序 的 Xcr Xcr Tss motif , , . 生物信息学分析 同时 对 Xcr中所含有的Tss与其他病原菌中同源序列之间的遗传关系进行分析 明确 Xcr , 、 、 , , 中存在 个 分别命名为 上述 均含有高于 比例的a螺旋结构 均定位在细胞膜 ３ Tss TssA TssBTssC Tss ５０％ , , . 、 上以及具有 个保守 而就信号肽而言 仅