细菌分类与鉴定ppt课件.ppt

微生物的分类和鉴定; 地球上的物种估计大约有150万，其中微生物超过10万种，而且其数目还在不断增加。;生物分类的二种基本原则：;一、分类单元及其等级;常用的细菌分类学术语：;3）型(form或type)：常指亚种以下的细分。当同种或同亚种不同菌株之间的性状差异，不足以分为新的亚种时，可以细分为不同的型。（如不同血清型、噬菌型等）;二、细菌的命名;属名重复出现，可缩写 如：E.coli （大肠杆菌）； S. pullorum（鸡白痢沙门氏菌） 只确定属名，未确定种名的某一株细菌 Salmonella sp. 只确定属名，未确定种名的若干菌株Salmonella spp. 亚种用subsp.（正体）表示 Pasteurella multocida subsp. septica ;由于细菌分类单元的划分缺乏一个易于操作的统一标准， 为了减少因采用不同标准界定分类单元所造成的混乱， 细菌系统分类也像其他生物分类一样采用“模式概念”;细菌分类命名权威杂志:国际系统与进化微生物学杂志（International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology,IJSEM）;二、 原核微生物分类系统;1923年以来已出至第九版(1994)； 第九版伯杰氏细菌鉴定手册设立35个群，将古细菌部改编为5个群，全书描写了约500个属。 划分为四大类： 第一类 具细胞壁的革兰氏阴性真细菌 第二类 具细胞壁的革兰氏阳性真细菌 第三类 无细胞壁的真细菌 第四类 古细菌 ;（二）伯杰氏系统细菌学手册 (Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology);四、微生物分类鉴定的依据 ;五、微生物分类鉴定的方法;形态学特征;一、形态学特征;二、生理生化特征;1、 API 细菌数值鉴定系统 2、 Enterotube 系统 3、 Biolog 全自动或手动细菌鉴定系统 ;1、 API 细菌数值鉴定系统;2、Enterotube 系统;3、Biolog全自动或手动细菌鉴定系统 ;分子生物学指标;1. DNA的碱基组成(G+Cmol%); 每个生物种都有特定的GC%范围，因此 可以作为分类鉴定的指标。细菌的GC%范围为25--75%，变化范围最大，因此更适合于细菌的分类鉴定。; GC%测定主要用于对表型特征难区分的细菌 作出鉴定，并可检验表型特征分类的合理性， 从分子水平上判断物种的亲缘关系。; 同一个种内的不同菌株G+C含量差别应在4～5%以下；同属不同种的差别应低于10～15%； G+C含量已经作为建立新的微生物分类单元的一项基本特征，它对于种、属甚至科的分类鉴定有重要意义。;2. 核酸的分子杂交;3. 生物信息学分析;4、16S rRNA和系统发育树;(2). 特征序列或序列印记（signature sequence）;(3) 系统发育树(phylogenetic tree);16 S r RNA系统发育树;建立16 S r RNA系统发育树的意义;5、其它