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猪流行性腹泻病毒TaqMan荧光定量RT-PCR检测方法的建立及其初步应用的中期报告
【中期报告】
研究背景:
猪流行性腹泻病毒(Porcine epidemic diarrhea virus, PEDV)是一种严重威胁猪类养殖业的病毒,其感染可导致猪只腹泻严重,甚至死亡。近年来,PEDV在全球范围内造成了大量猪只的死亡和经济损失,成为了猪类养殖业的一大难题。因此,对PEDV的快速、准确的检测方法的研究具有重要意义。
研究目的:
建立一种基于TaqMan荧光定量RT-PCR技术的PEDV检测方法,并进行初步应用。
方法:
1、制备检测标准品
选取一份PEDV阳性样品,进行RNA提取和纯化,并进行定量。根据PEDV基因组序列设计一对特异性引物和探针,制备检测标准品。
2、建立TaqMan荧光定量RT-PCR检测方法
将已建立的PEDV检测标准品与未知样品RNA进行逆转录反应,利用TaqMan荧光定量RT-PCR技术进行检测。同时,利用已建立的检测标准品绘制标准曲线,计算未知样品中PEDV的检测值。
3、初步应用
利用建立的PEDV检测方法检测10批疑似PEDV感染的样品,同时利用商用试剂盒进行检测。比较两种方法的检测结果的一致性。
结果:
1、制备检测标准品
PEDV阳性样品RNA的纯化和定量均成功,制备得到了PEDV检测标准品。
2、建立TaqMan荧光定量RT-PCR检测方法
利用PEDV检测标准品绘制标准曲线,检测明确、结果可靠。
3、初步应用
10批疑似PEDV感染样品中,PEDV阳性样品的检出率为80%,与商用试剂盒检测结果一致。
结论:
建立的基于TaqMan荧光定量RT-PCR技术的PEDV检测方法准确可靠,初步应用结果良好,具有广阔的应用前景。
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