利用简单重复序列SSR标记分析太湖稻区现代粳稻品种的遗传多样性.PDF

Online system: 农 业 生 物 技 术 学 报 Journal of Agricultural Biotechnology 2014, 22(12): 1502~1513 DOI: 10.3969/j.issn. 1674-7968.2014.12.005 利用简单重复序列(SSR)标记分析太湖稻区现代粳稻品种的遗传 多样性 1，2* 1，2 1，2* 1，2 1，2 1 1 2 ，3 罗兵 徐港明 孙海燕 杨志刚 沈宗根 高阳 王小虎 端木银熙 1常熟理工学院生物与食品工程学院，常熟215500 ；2 国家杂交水稻工程技术研究中心常熟分中心，常熟215500 ；3 常熟市农业科学研究 所，常熟215500 *通讯作者，lbsong-001@163.com；sunhy@ 摘 要 太湖地区有丰富的粳稻(Oryzasatiuassp.japonica)种植资源，随着品种大面积推广应用，育种材 料的遗传基础趋窄，相似性增高，使粳稻育种突破困难。本研究利用分布于水稻(OryzasatiuaL.) 12条染 色体上的24 对简单重复序列(simple sequence repeat, SSR) 引物对太湖地区的42 份粳稻品种进行遗传多 样性分析。结果表明，有23 对SSR 引物在42 份粳稻材料间表现出多态性；23 对引物共检测到105个等位 基因，每对SSR 引物检测到等位基因为2~8 个，平均为4.57 个，有效等位基因共有56.43 个，平均每个位点 为2.45 个。每个多态位点的多态信息含量(polymorphism information content, PIC)变幅为0.083 0~0.807 9，平均为0.496 6；每个粳稻材料多态性位点数的变幅为6~ 19，等位基因总数的变幅为27~55；42 份粳稻 品种间的遗传相似系数变幅为0.391~0.990，平均为0.610，遗传相似系数在0.50~0.80 之间的材料占全部 的74.45% ，供试材料相似度高；非加权配对算术平均法(unweighed pair group method with arithmetic mean; UPGMA)聚类结果显示，遗传相似系数为0.50，42 份粳稻材料可以分为两个类群，一个类群包含19 份常规粳稻，另一个类群包括其他23 份杂交粳稻。结果显示，太湖地区的粳稻品种总体上遗传背景相似 度高，遗传多样性不够丰富，育种工作有待进一步加强新的基因资源引进和利用，创新水稻育种材料。本 研究结果为新品种选育提供技术支持和理论根据。 关键词 粳稻，简单重复序列(SSR)标记，遗传多样性 Genetic Diversity Analysis of Modern Japonica Rice (Oryzasatiua L.) from Taihu Area Based on Simple Sequence Repeat (SSR) Markers LUO Bing1,2* XU Gang-Ming1,2 SUN Hai-Yan1,2* YANG Zhi-Gang1,2 SHEN Zong-Gen1,2 GAO Yang1 WANG Xiao-Hu1 DUANMU Yin-Xi2,3 1 College of Biology and Food Engineering, Changshu Institute of Technology, Changshu 215500, China; 2 Changshu Branch Center, China National Hybrid Rice Reserch and Development Center, Changshu 215500, China; 3 Changshou Academy of Agricultural Science, Changshu 215500, China * Corresponding authors, lbsong-001@163.com; sunhy@ Abstract T