刚地弓形虫表面抗原相关序列蛋白SRS40E的生物信息学解析.docx
刚地弓形虫表面抗原相关序列蛋白SRS40E的生物信息学解析
目录
刚地弓形虫表面抗原相关序列蛋白SRS40E的生物信息学解析（1）．．4
内容简述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．4
1.1研究背景．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．5
1.2研究目的．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．6
1.3研究方法概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．7
刚地弓形虫概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．8
2.1刚地弓形虫的生物学特性．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．9
2.2弓形虫病的流行病学．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．10
2.3刚地弓形虫感染与疾病的关系．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．11
表面抗原相关序列蛋白SRS40E简介．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．12
3.1SRS40E蛋白的功能与作用．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．13
3.2SRS40E蛋白在弓形虫生命周期中的作用．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．14
3.3SRS40E蛋白的结构分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．16
生物信息学分析方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．17
4.1序列获取与预处理．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．18
4.2序列比对与同源性分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．19
4.3蛋白结构预测与功能注释．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．20
4.4蛋白进化分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．21
SRS40E蛋白序列分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．23
5.1序列保守性分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．24
5.2序列变异与突变分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．25
5.3序列与已知蛋白的相似性比较．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．26
SRS40E蛋白结构预测与功能注释．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．27
6.1蛋白三级结构预测．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．29
6.2蛋白功能位点分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．30
6.3蛋白与信号通路的关系．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．31
SRS40E蛋白进化分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．32
7.1系统发育树构建．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．34
7.2进化速率分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．35
7.3蛋白进化模式探讨．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．37
SRS40E蛋白在疾病诊断与治疗中的应用前景．．．．．．．．．．．．．．．．．38
8.1疾病诊断标志物的开发．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．39
8.2抗体药物的设计与开发．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．41
8.3疫苗设计的启示．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．42
刚地弓形虫表面抗原相关序列蛋白SRS40E的生物信息学解析（2）．44
内容综述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．44
1.1研究背景．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．44
1.2研究目的与意义．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．45
1.3研究方法概述．．．．．．．．．．．．．．．．