北京地区流行性腮腺炎病毒流行株基因型分析.pdf

维普资讯 中国公共卫生 2006年 9月第 22卷第 9期 ChinJPublicHealthSep2006Vo1．22No．9 11O5 文章编号：1001．0580(2006)09—1105．02 中图分类号：R373．16 文献标识码：A 论【 著】 北京地区流行性腮腺炎病毒流行株基因型分析 陈萌 ．一，陈丽娟 ，张铁钢 ，杨洁 ，和京果 ，张伟 摘 要：目的 了解北京地区流行性腮腺炎病毒流行株基因型分布和变异情况。方法 通过SH基因的序列分 析，与其他基因型参考株进行同源性比较，构建亲缘进化树。结果 17株病毒均属于F基因型，VAC-S79属于A基因 型，各流行株间核苷酸最大差异为5．4％，与 F基因型代表株Z77158(兰州)、Z77160(上海)核苷酸最大差异分别为 4．8％和 7．0％；与疫苗株的核苷酸差异为 14．6％～15．9％。结论 近 2年北京地区流行的优势株为F基因型，未发 现基因型间变异，但存在较大的型内差异，有变异增大趋势，需进行持续的分子流行病学监测。 关键词：流行性腮腺炎病毒；基因型 ；分子流行病学；变异 AnalysisongenotypeofmumpsvirusstraincirculatinginBeringcity CHENMeng，CHENLijuan，ZHANGTiegang，et a1．BeijingCenterforDiseaseControlandPrevention(Beijing100013，China) Abstract：Objective Tounderstandgeographicdistributionofmumpsvirusgenotypesandvariationofcirculating mumpsviursstrainsinBeijing．Methods SH geneswereanalyzed．GenetichomologybetweentheBeijingstrainsandother referencemumpsstrainswereanalyzed．Results 17strainswereallgenotypeF，andVAC-S79wasgenotypeA ．Thecirculat— ingviursesshowed5．4％sequencedivergence，and4．8％sequencedivergencefromZ77158(Lanzhou)；7．0％fromZ77160 (Shanghai)；14．6％～15．9％fromVAC-s79．Conclusion GenotypeFisthemaingenotypeofcirculatingstrainsinBeijing． A1thoughallthecirculatingstrains havegenotypeF，therearesomevariations betweenthem ．Astherateofvariationistend tOincrease，itseemsnecessarytOfollow upthemolecularepidemiology． Keywords：mumpsviurs；genotype；molecularepidemiology；variation 2005年全国报告传染病突发公共卫生事件 1055起，其 366)SH—HN基因间区域；(367—378)HN基因5非编码区(s3。 中流行性腮腺炎突发事件为 264起，占25％。流行性腮腺炎 使用M—MLV逆转录酶和 Taq酶 (美 国Promega公 司)进行 病毒只有单一血清型 [13，但截止到 2005年 9月，国际上已经 RT．PCR检测。对阳性结果的 PCR产物用 PCRPurification 从分子流行病水平将其分成了 12个基 因型 (genotypeA．L)， Kit(德 国QIAGEN公司)回收。测序用 BigDYETerminator 而且新的基因型不断出现[