免疫沉淀原理与实验步骤.PDF
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免疫沉淀原理及实验步骤
免疫沉淀(Immunoprecipitation, IP)原理
IP 是利用抗原蛋白质和抗体的特异性结合以及细菌蛋白质的
“protein A/G特异性地结合到抗体(免疫球蛋白) 的 FC 片段的现象开
发出来的方法。目前多用protein A/G 预先结合在argarose beads 上,
使之与含有抗原的溶液及抗体反应后,beads 上的prorein A/G 就能达
到吸附抗原的目的。通过低速离心,可以从含有目的抗原的溶液中将
目的抗原与其它抗原分离。
免疫沉淀实验的操作步骤比较多,同时由于在非变性条件下进行
实验,所以要得到一个完美的实验结果,不仅需要高质量的抗体,同
时对免疫沉淀体系也需要有严格的控制指标。免疫沉淀实验从:蛋白
样品处理;抗体-agarose beads 孵育;抗体-agarose beads 复合物洗涤
到最后的鉴定,每步都非常关键,需要严格控制实验流程中每个关键
步骤的质量,才能最终达到你的实验目的。
IP 实验步骤
基本实验步骤
(1)收获细胞,加入适量细胞 IP 裂解缓冲液(含蛋白酶抑制剂),冰上
或者4 ℃裂解30min, 12,000g 离心30 min 后取上清;
(2) 取少量裂解液以备Western blot 分析,剩余裂解液将 1μg 相应的
抗体和 10-50 μl protein A/G-beads 加入到细胞裂解液,4°C 缓慢摇晃
孵育过夜;
(3)免疫沉淀反应后,在4°C 以3,000 g 速度离心 5 min,将protein
A/G-beads 离心至管底;将上清小心吸去,protein A/G-beads 用 1ml
裂解缓冲液洗3 -4 次;最后加入 15μl 的2×SDS 加样缓冲液,沸水
煮10 分钟;
(4)SDS, Western blotting 或进行质谱分析。
具体步骤
一、 样品处理:
免疫沉淀实验成功与否,第一步处理样品非常关键。免疫沉淀实
验本质上是处于天然构象状态的抗原和抗体之间的反应,而样品处理
的质量决定了抗原抗体反应中的抗原的质量,浓度以及抗原是否处于
天然构象状态。所以制备高质量的样品以用于后续的抗体-agarose
beads 孵育对免疫沉淀实验是否成功非常关键。在这个环节中,除了
要控制所有操作尽量在冰上或者4°完成外,最为关键的是裂解液的成
份。
用于免疫沉淀实验的样品一般是原代培养细胞裂解液或者细胞
系裂解液。我们以常用的RIPA 裂解液为例(主要含有pH7.4 左右的离
子缓冲液,接近生理浓度下的 NaCl ,一定比例的去垢剂和甘油以及
各类蛋白酶抑制剂等)来说明其各主要成份的用途,进而帮助我们如
何针对不同的实验目的和不同的蛋白质特性来选择最佳的裂解液。
a . 缓冲液:离子缓冲液常采用pH7.4 的Hepes 或者Tris-Cl 。
b . NaCl 浓度一般习惯用 150 mM,这主要是因为150 mM 接近
生理浓度,不会破坏蛋白质之间的相互作用。然而细胞内部的 NaCl
浓度并不是均一的,局部NaCl 的浓度可以低到50 mM ,150 mM 的
NaCl 有可能会破坏这个区域的蛋白质相互作用。因此裂解液配方最
佳的NaCl 浓度要视所分析的蛋白的亚细胞定位而定。
c . 甘油由于其粘性,可以对蛋白质之间的相互作用起到一个很
好的保护作用。一般添加 10%的甘油有助于稳定蛋白质之间的相互作
用。
d . 裂解液中的去垢剂可以裂解细胞质膜,也同时破坏了许多细
胞器的膜,从而释放了其中储存的许多蛋白酶。而由于用于免疫沉淀
实验的去垢剂作用比较温和,因此蛋白酶的活性大部分得以保存。还
有一部分蛋白酶来自胞质中,主要由于其抑制蛋白或者其活性抑制环
境受到改变后从而恢复了蛋白酶活性。因此,添加蛋白酶抑制剂对于
防止目的蛋白的降解从而完成免疫沉淀实验非常关键。一般主要通过
添加EDTA 抑制金属蛋白酶,通过Protease Cocktail(多种蛋白酶抑制
剂混合物)可以抑制蛋白酶。
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