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GB/T 36136-2018结核分枝杆菌耐药基因芯片检测基本要求.pdf

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ICS 11.040.55 C 30 £3© 中华人民共和国国家标准 GB/T 36136—2018 结核分枝杆菌耐药基因芯片检测 基本要求 General requirements of DNA array-based M. tuberculosis drug resistance detection 2018-05-14 发布 2018-12-01 实施 发布 GB/T 36136—2018 -XX. —1— 5 本标准按照GB/T 1.1—2009给出的规则起草。 本标准由全国生物芯片标准化技术委员会(SAC/TC 421)提出并归口。 本标准起草单位:博奥生物集团有限公司、中国疾病预防控制中心。 本标准主要起草人:郭永、祝令香、赵雁林、刘莹莹、王璨、项光新、逢宇。 GB/T 36136—2018 结核分枝杆菌耐药基因芯片检测 基本要求 1范围 本标准规定了结核分枝杆菌耐药基因芯片检测基本要求。 本标准适用于源自临床样品的结核分枝杆菌对常用一、二线抗结核药物的耐药性相关基因的检测。 2规范性引用文件 下列文件对于本文件的应用是必不可少的 。凡是注日期的引用文件,仅注日期的版本适用于本文 件 。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。 YY/T 1153 体外诊断用DNA微阵列芯片 YY/T 1154激光共聚焦扫描仪 医疗机构临床基因扩增管理办法 (卫办医政发 [2010]194号) 3缩略语 下列缩略语适用于本文件。 DNA :脱氧核糖核酸 (Deoxyribonucleic Acid) PCR:聚合酶链反应(Polymerase Chain Reaction) 4原理 根据临床常见的结核分枝杆菌耐药基因的特异性保守核酸序列,设计特异性的PCR扩增引物及相 应的寡核背酸探针。 以临床样品中分离的结核分枝杆菌DNA为模板,加入带有末端发光标记物的引物,运用PCR技 术扩增其耐药基因目标片段,扩增后的待测DNA即带有发光标记物。 将标记有发光标记物的PCR扩增产物与芯片上的探针在一定的条件下进行杂交反应 ,根据碱基互 补配对原则,序列匹配的PCR扩增产物与探针形成稳定的二级结构 。根据探针在芯片上的特定排布位 置,就可以检测出相应被测DNA的相关信息,推断出样品的耐药基因信息。 5仪器材料与试剂 5.1仪器与材料 应符合YY/T 1154要求并获得医疗器械注册证书的微阵列芯片扫描仪、微阵列芯片杂交盒、核酸 扩增仪、芯片杂交仪 (备选)、芯片洗干仪 (备选)、冰箱 (一20 °C )、微量加样器及加样器吸头、恒温水浴 锅、微量离心机、离心管、恒温摇床、芯片洗涤容器及玻片架。 1 GB/T 36136—2018 5.2试剂 一般包含芯片、盖片、PCR扩增试剂、阳性对照品、阴性对照品、杂交缓冲液、冰水混合物、水、临床 样品液化试剂 (将临床痰样本进行液化处理)、缓冲液等组成部分,其中芯片应符合YY/T 1153要求。 6样本采集与处理 6.1培养物样本 6.1.1固体培
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