拟南芥TDNA插入突变体的鉴定.pdf
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遗传学实验报告
拟南芥T-DNA插入突变体的鉴定
一、实验目的:
1、学习和掌握基本的植物DNA的CTAB提取法,掌握PCR、琼脂糖凝胶电泳等基本实验操
作技能
2、了解T-DNA插入突变体的鉴定原理,掌握其方法。
二、实验原理
1、拟南芥(Arabidopsisthaliana)
十字花科,植物遗传学、发育生物学和分子生物学的模式植物。
➢植株形态个体小,高度只有30cm左右;
➢生长周期快,从播种到收获种子一般只需8周左右;
➢种子多,每株可产生数千粒种子;
➢形态特征简单,生命力强,用普通培养基就可作人工培养;
➢遗传转化简单,转化效率高;
➢基因组小,只有5对染色体,125MB;
➢在2000年,拟南芥成为第一个基因组被完整测序的植物。
2、突变体
突变体是遗传学研究的最重要材料。
突变体可以通过自然突变和人工诱变的方法获得。
拟南芥诱变常用方法有EMS诱变、T-DNA插入突变、激活标签。
由于T-DNA插入突变体便于对突变基因进行追踪,目前拟南芥、水稻中已经有大量的
T-DNA插入突变体;SALK中心提供的拟南芥T-DNA插入突变体超过十万种。
3、T-DNA插入突变原理
T-DNA,转移DNA(transfeedDNA),是根瘤农杆菌Ti质粒中的一段DNA序列,可
以从农杆菌中转移并稳定整合到植物基因组。人们将目的基因插入到经过改造的T-DNA
区,借助农杆菌的感染实现外源基因向植物细胞的转移与整合,获得转基因植株。
除用于转基因以外,T-DNA插入到植物的基因中可引起基因的失活,从而产生基因敲
除突变体,T-DNA大多为单拷贝插入,使其利于进行遗传分析。
4、T-DNA插入突变体PCR鉴定
图1结果鉴定图2PCR引物设计
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三、实验材料
1、材料:T-DNA插入的突变拟南芥植株;
2、仪器:离心管,离心机,水浴锅,移液枪,PCR仪,电泳槽等;
3、试剂:液氮,CTAB提取液,氯仿/异戊醇(24:1),无水乙醇,70%乙醇,10xTaq
buffer,MgCl2,引物,琼脂糖,溴化乙锭(EB)。
四、实验步骤
1、植物DNA提取方法(CTAB法)
1)水浴加热CTAB提取液至65℃;
2)取叶片100mg,液氮研磨成粉末;
3)加入600µlCTAB提取液并混匀;
4)65℃水浴45min(至少30min);
5)12,000rpm离心10min;
6)将上清转移到新离心管,加入等体积氯仿/异戊醇,混匀;
7)12,000rpm离心5-10min,将上清液转移到新管中;
8)向上清中加入1/10体积3MNaAc,再加入预冷的等体积异丙醇或2V无水乙醇,混匀冰上
放置10min;
9)12,000rpm离心10min,弃上清,加入500µl70%乙醇洗涤2min;
10)12,000rpm离心5min,弃上清,吸干残留并干燥;
11)加20-50µlTE缓冲液溶解DNA。
2、PCR反应
1)引物设计
➢LP:5’-TCATCCACCATGGAAGAAAAG
➢RP:5’-TTGGATACGATGCGAGTAAAC
➢BP:5’-TTGTTCACGTAGTGGGCCATCG
➢LP+RP:1107bp
➢BP+RP:560-860bp
2)PCR反应体系
➢H2O:12.4μl
➢10×Buffer:2μl
➢dNTP:0.5μl
➢MgCl2:2μl
➢LP/BP:0.5μl
➢RP:0.5μl
➢Taq:0.1μl
➢DNA:2μl
➢Total:20μl
3)PCR温度设定
➢94℃5min
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➢33cycle
变性:94℃30s