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拟南芥TDNA插入突变体的鉴定.pdf

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遗传学实验报告

拟南芥T-DNA插入突变体的鉴定

一、实验目的:

1、学习和掌握基本的植物DNA的CTAB提取法,掌握PCR、琼脂糖凝胶电泳等基本实验操

作技能

2、了解T-DNA插入突变体的鉴定原理,掌握其方法。

二、实验原理

1、拟南芥(Arabidopsisthaliana)

十字花科,植物遗传学、发育生物学和分子生物学的模式植物。

➢植株形态个体小,高度只有30cm左右;

➢生长周期快,从播种到收获种子一般只需8周左右;

➢种子多,每株可产生数千粒种子;

➢形态特征简单,生命力强,用普通培养基就可作人工培养;

➢遗传转化简单,转化效率高;

➢基因组小,只有5对染色体,125MB;

➢在2000年,拟南芥成为第一个基因组被完整测序的植物。

2、突变体

突变体是遗传学研究的最重要材料。

突变体可以通过自然突变和人工诱变的方法获得。

拟南芥诱变常用方法有EMS诱变、T-DNA插入突变、激活标签。

由于T-DNA插入突变体便于对突变基因进行追踪,目前拟南芥、水稻中已经有大量的

T-DNA插入突变体;SALK中心提供的拟南芥T-DNA插入突变体超过十万种。

3、T-DNA插入突变原理

T-DNA,转移DNA(transfeedDNA),是根瘤农杆菌Ti质粒中的一段DNA序列,可

以从农杆菌中转移并稳定整合到植物基因组。人们将目的基因插入到经过改造的T-DNA

区,借助农杆菌的感染实现外源基因向植物细胞的转移与整合,获得转基因植株。

除用于转基因以外,T-DNA插入到植物的基因中可引起基因的失活,从而产生基因敲

除突变体,T-DNA大多为单拷贝插入,使其利于进行遗传分析。

4、T-DNA插入突变体PCR鉴定

图1结果鉴定图2PCR引物设计

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三、实验材料

1、材料:T-DNA插入的突变拟南芥植株;

2、仪器:离心管,离心机,水浴锅,移液枪,PCR仪,电泳槽等;

3、试剂:液氮,CTAB提取液,氯仿/异戊醇(24:1),无水乙醇,70%乙醇,10xTaq

buffer,MgCl2,引物,琼脂糖,溴化乙锭(EB)。

四、实验步骤

1、植物DNA提取方法(CTAB法)

1)水浴加热CTAB提取液至65℃;

2)取叶片100mg,液氮研磨成粉末;

3)加入600µlCTAB提取液并混匀;

4)65℃水浴45min(至少30min);

5)12,000rpm离心10min;

6)将上清转移到新离心管,加入等体积氯仿/异戊醇,混匀;

7)12,000rpm离心5-10min,将上清液转移到新管中;

8)向上清中加入1/10体积3MNaAc,再加入预冷的等体积异丙醇或2V无水乙醇,混匀冰上

放置10min;

9)12,000rpm离心10min,弃上清,加入500µl70%乙醇洗涤2min;

10)12,000rpm离心5min,弃上清,吸干残留并干燥;

11)加20-50µlTE缓冲液溶解DNA。

2、PCR反应

1)引物设计

➢LP:5’-TCATCCACCATGGAAGAAAAG

➢RP:5’-TTGGATACGATGCGAGTAAAC

➢BP:5’-TTGTTCACGTAGTGGGCCATCG

➢LP+RP:1107bp

➢BP+RP:560-860bp

2)PCR反应体系

➢H2O:12.4μl

➢10×Buffer:2μl

➢dNTP:0.5μl

➢MgCl2:2μl

➢LP/BP:0.5μl

➢RP:0.5μl

➢Taq:0.1μl

➢DNA:2μl

➢Total:20μl

3)PCR温度设定

➢94℃5min

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➢33cycle

变性:94℃30s

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