玉米RTE基因家族的鉴定与表达模式分析.docx

玉米RTE基因家族的鉴定与表达模式分析

目录

玉米RTE基因家族的鉴定与表达模式分析（1）．．．．．．．．．．．．．．．．．．．4

内容概要．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．4

1.1研究背景．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．4

1.2研究目的．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．5

1.3研究方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．6

玉米RTE基因家族概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．7

2.1RTE基因的定义与功能．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．8

2.2玉米RTE基因家族的进化与分类．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．10

2.3RTE基因在玉米生长发育中的作用．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．11

玉米RTE基因家族的鉴定．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．12

3.1基因序列检索与筛选．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．13

3.2同源基因比对与分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．14

3.3基因家族成员的鉴定．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．15

玉米RTE基因的表达模式分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．16

4.1表达数据获取．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．17

4.2表达模式分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．18

4.2.1不同组织表达模式．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．19

4.2.2不同发育阶段表达模式．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．20

4.2.3不同环境条件下的表达模式．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．21

玉米RTE基因家族成员的功能验证．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．22

5.1功能基因的克隆与表达．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．23

5.2功能验证实验设计．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．24

5.2.1生物信息学预测．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．25

5.2.2体外实验验证．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．26

5.2.3体内实验验证．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．27

玉米RTE基因家族成员的调控机制研究．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．29

6.1调控元件的识别与预测．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．30

6.2调控因子与RTE基因的相互作用．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．31

6.3调控网络构建与分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．32

玉米RTE基因家族的鉴定与表达模式分析（2）．．．．．．．．．．．．．．．．．．34

一、内容简述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．34

二、文献综述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．34

RTE基因家族概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．35

玉米基因研究现状．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．37

基因表达模式分析技术进展．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．38

三、实验材料与方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．39

实验材料．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．40

实验试剂与仪器．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．42

实验方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．