野油菜黄单胞菌xcc8004双组分信号转导系统基因及-植物病理学报.pdf

植物病理学报 ＡＣＴＡ ＰＨＹＴＯＰＡＴＨＯＬＯＧＩＣＡ ＳＩＮＩＣＡ　 ４５(２):１３９￣１５０(２０１５) ｄｏｉ:１０.１３９２６/ｊ.ｃｎｋｉ.ａｐｐｓ.２０１５.０２.００４ 野油菜黄单胞菌Ｘｃｃ８００４双组分 信号转导系统基因及其蛋白架构分析 １ １ １ １ １ꎬ２ １ꎬ２∗ 潘俊霞 ꎬ付 珊 ꎬ姚任之 ꎬ唐学慧 ꎬ何勇强 ꎬ姜 伟 １ ２ ( 广西大学生命科学与技术学院ꎬ南宁５３０００４ꎻ 亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室ꎬ南宁５３０００４) 摘要:Ｘａｎｔｈｏｍｏｎａｓ ｃａｍｐｅｓｔｒｉｓ ｐｖ. ｃａｍｐｅｓｔｒｉｓ(Ｘｃｃ８００４)是一个拥有复杂代谢循环的革兰氏阴性植物病原菌ꎬ它能侵染几乎 所有的十字花科植物引起黑腐病ꎮ 基因注释表明ꎬ该基因组存在大量编码双组分信号转导系统的基因ꎬ本研究利用生物信 息学方法鉴定编码双组分信号转导系统感受蛋白和响应调控蛋白基因ꎬ结果表明ꎬＸｃｃ ８００４共有 １１１个双组分信号转导系 统基因ꎬ５５个感受基因中的３０个与响应调控基因成对存在ꎬ很有可能组成一个双组分信号转导系统ꎬ２５个感受基因和２６ 个响应调控基因独立存在于基因组中ꎮ 另外ꎬ还发现３个ＨＫｓ和２个ＲＲｓ未被注释ꎮ 本文拟通过分析双组分信号转导系 统基因及其编码蛋白的功能域架构ꎬ为Ｘｃｃ８００４双组分调控系统的功能研究和防治病害提供参考ꎮ 关键词:十字花科黑腐病菌ꎻ生物信息学ꎻ双组分信号转导系统ꎻ功能域架构 Ｉｎｓｉｌｉｃｏａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ ｔｗｏ ｃｏｍｐｏｎｅｎｔ ｓｙｓｔｅｍ ｇｅｎｅｓ ａｎｄ ｉｔｓ ｐｒｏｔｅｉｎ ｄｏｍａｉｎ ａｒｒａｎｇｅ￣ ｍｅｎｔ ｉｎ Ｘａｎｔｈｏｍｏｎａｓ ｃａｍｐｅｓｔｒｉｓ ｐｖ. ｃａｍｐｅｓｔｒｉｓ ８００４ １ １ 　 ＰＡＮ Ｊｕｎ￣ｘｉａ ꎬＦＵ Ｓｈａｎ ꎬＹＡＯ １ １ １ꎬ２ １ꎬ２ １ Ｒｅｎ￣ｚｈｉ ꎬＴＡＮＧＸｕｅ￣ｈｕｉ ꎬＨＥ Ｙｏｎｇ￣ｑｉａｎｇ ꎬＪＩＡＮＧＷｅｉ 　 ( ＣｏｌｌｅｇｅｏｆＬｉｆｅＳｃｉｅｎｃｅａｎｄＴｅｃｈｎｏｌｏｇｙꎬＧｕａｎｇｘｉ ２ ＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙꎬＮａｎｎｉｎｇ ５３０００４ꎬＣｈｉｎａꎻ Ｓｔａｔｅ Ｋｅｙ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ ｆｏｒ Ｃｏｎｓｅｒｖａｔｉｏｎ ａｎｄ Ｕｔｉｌｉｚａｔｉｏｎ ｏｆ Ｓｕｂｔｒｏｐｉｃａｌ Ａｇｒｏ￣ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓꎬ Ｎａｎｎｉｎｇ ５３０００４ꎬＣｈｉｎａ) Ａｂｓｔｒａｃｔ:Ｘａｎｔｈｏｍｏｎａｓ ｃａｍｐｅｓｔｒｉｓ ｐｖ.ｃａｍｐｅｓｔｒｉｓ８００４ (Ｘｃｃ ８００４) ｉｓ ａ Ｇｒａｍ￣ｎｅｇａｔｉｖｅ ｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｔｈａｔ ｕｎｄｅｒ￣ ｇｏｅｓ ａ ｃｏｍｐｌｅｘ ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔａｌｌｉｆｅｃｙｃｌｅ.Ｉｔｉｓｔｈｅｃａｕｓａｌａｇｅｎｔ ｏｆｂｌａｃｋｒｏｔ ｄｉｓｅａｓｅｏｆｃｒｕｃｉｆｅｒｏｕｓｐｌａｎｔｓ.Ｔｈｅｇｅ￣ ｎｏｍｅ ａｎｎｏｔａｔｉｏｎ ｈａｓ ｄｅｍｏｎｓｔｒａｔｅｄ ｔｈｅ ｐｒｅｓｅｎｃｅ ｏｆ ａ ｓｉｇｎｉｆｉｃａｎｔ ｎｕｍｂｅｒ ｏｆ ｔｈｅｓｅ ｂｅｉｎｇ ｐｕｔａｔｉｖｅ ｔｗｏ￣ｃｏｍｐｏｎｅｎｔ ｓｉｇｎａｌ ｔｒａｎｓｄｕｃｔｉｏｎ ｓｙｓｔｅｍ (ＴＣＳ)ｐｒｏｔｅｉｎ.Ｔｈｉｓ ｓｔｕｄｙ ｕｓｅｄ ｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓｍｅｔｈｏｄｓｔｏ ｉｄｅｎｔｉｆｙ ｓｅｎｓｏｒ ｋｉｎａｓｅ ａｎｄ ｒｅｓｐｏｎｓｅ ｒｅｇｕｌａｔｏｒ ｇｅｎｅｓ.Ｔｈｅ ａｎａｌｙｓｉｓｒｅｖｅａｌｅｄ ｔｈｅｐｒｅｓｅｎｃｅ ｏｆ １１１ＴＣＳｇｅｎｅｓꎬｉｎ ｗｈｉｃｈ３０ｏｆ５５ｓｅｎｓｏｒ ｋｉｎａｓｅ ｇｅｎｅｓｌａｙ ａｄｊａｃｅｎｔ ｔｏ