不同连作年限草莓根际细菌和真菌多样性变化-微生物学报.PDF

微生物学通报 Jun. 20, 2017, 44(6): 1377−1386 Microbiology China /wswxtbcn tongbao@ DOI: 10.13344/j.microbiol.china.170170 研究报告 不同连作年限草莓根际细菌和真菌多样性变化 1 2* 1 2 赵帆 赵密珍 王钰 庞夫花 (1. 230601) (2. 210014) 摘 要：【目的】以不同连作年限草莓根际土壤为材料，探讨不同连作年限土壤细菌、真菌多 样性的变化，以期为草莓连作障碍调控提供理论依据。【方法】将没有连作(CK) 、连作 1 年(1Y) 、 连作 8 年(8Y)的土壤分别与珍珠岩以3:1 的体积充分混匀装盆，“宁玉”草莓苗于 2016 年 9 月 10 日定植于盆栽土壤中，定植后50 d 时(开花前)进行土壤取样，提取基因组DNA ，通过PCR 扩增建立文库，利用MiSeq 平台Illumina 第二代高通量测序技术并结合相关生物信息学方法，分 析土壤细菌16S rRNA基因V4+V5 区域和真菌ITS1+ITS2 区域的丰富度和多样性指数以及群落 结构。【结果】从9 个草莓根际土壤样本中获得3 192 个细菌分类操作单元OTU 和762 个真菌OTU ， 其中，变形菌门、厚壁菌门、放线菌门、拟杆菌门和蓝藻门为草莓根际土壤的优势菌种，在 CK 、1Y、8Y 草莓根际土壤中分别占细菌总数的87.86%、64.83%和61.79%；子囊菌门和担子 菌门为优势真菌，在CK 、1Y、8Y 草莓根际土壤中分别占真菌群落的69.17% 、69.06%和76.18%。 从门的分类水平看，酸杆菌门、放线菌门、拟杆菌门、厚壁菌门、绿弯菌门、蓝菌门、浮霉菌 门、芽单胞菌门、变形菌门以及真菌担子菌门、接合菌门、壶菌门的比例在不同连作年限的草 莓根际土壤中显著改变(P0.05) 。属水平的分析也表明，共有29 个细菌属和 19 个真菌属的比 例发生改变(P0.05) 。【结论】随连作年限的延长，草莓根际土壤生态系统中细菌和真菌群落各 门类组成的比例会发生显著变化。 关键词：草莓，根际土壤，Illumina 高通量测序，土壤细菌，土壤真菌 Biodiversity of bacteria and fungi in rhizosphere of strawberry with different continuous cropping years ZHAO Fan1 ZHAO Mi-Zhen2* WANG Yu 1 PANG Fu-Hua2 (1. School of Resources and Environment Engineering, Anhui University, Hefei, Anhui 230601, China) (2. Jiangsu Academy of Agricultural Sciences, Institute of Pomology, Jiangsu Key Laboratory for Horticultural Crop Genetic Improvement, Nanjing, Jiangsu 210014, China) Abstract: [Objective] The aim of this study was to explore the changes of soil bacteria and fungal Foundation item: Modern Agriculture Research and Development Demonstration Project of Jia