流程大放送染色质免疫共沉淀测序chip-seq cxk.pdf

#流程大放送#染色质免疫共沉淀（ChIP-seq）

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介绍

染色质免疫共沉淀技术（ChromatinImmunoprecipitation，

ChIP）也称结合位点分析法，是研究体内蛋白质与相互作

用的有力工具，通常用于转录因子结合位点或组蛋白特异性修饰

位点的研究。将ChIP与第二代技术相结合的ChIP-Seq技术，

能够高效地在全组范围内检测与组蛋白修饰、转录因子等互

互作的区段信息

该项技术可用于以下研究

1）处于特定时期或特定处理条件下的样本中，特定转录因子

在上的结合位置检测；

2）各种类型组蛋白修饰在上的分布特征；

3）疾病样本中，与疾病发生发展相关的组蛋白修饰表观遗传

机理研究和相关表观分子标志的探索性研究；

4）研究其他各类与能发生互作的蛋白因子在上

的定位特征；

数据处理和分析流程图

预期示例图展示

示例图1多样本差异Peak区域热图展示

示例图2不同条件处理下转录因子结合位点上的PolII信号强弱动态

变化

示例图3Peak区域内的碱基构成分布和转录因子基序分析[1]

示例文献

[1].He,H.H.,etal.,Nucleosomedynamicsdefinetranscriptionalenhancers.

NatGenet,2010.42(4):p.343-7.