银杏R2R3MYB基因家族鉴定及其在花青素合成中的作用.docx
银杏R2R3MYB基因家族鉴定及其在花青素合成中的作用
目录
银杏R2R3MYB基因家族鉴定及其在花青素合成中的作用（1）．．．．．．．3
一、内容概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．3
研究背景．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．3
研究意义．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．4
二、银杏R2R3MYB基因家族鉴定．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．5
银杏基因组概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．5
1.1基因组大小与结构特点．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．6
1.2基因组测序与组装情况．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．6
R2R3MYB基因家族的鉴定方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．7
2.1生物信息学方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．8
2.2分子生物学实验验证．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．8
2.3基因序列分析软件．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．9
银杏R2R3MYB基因家族的成员分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．11
3.1成员数量与分布特点．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．12
3.2基因结构与功能特点．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．13
三、银杏R2R3MYB基因在花青素合成中的作用研究．．．．．．．．．．．．．．．14
花青素合成途径概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．15
1.1花青素合成相关基因与酶类．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．16
1.2花青素合成途径的调控机制．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．17
R2R3MYB基因对花青素合成的影响．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．18
2.1转基因植物中的功能验证．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．18
2.2银杏不同组织部位中基因表达与花青素含量的关系分析．．．．．．19
2.3R2R3MYB基因对花青素合成关键酶基因的调控作用研究．．．．．．．20
四、实验结果与分析讨论．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．21
银杏R2R3MYB基因家族鉴定及其在花青素合成中的作用（2）．．．．．．22
内容综述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．22
1.1背景介绍．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．23
1.2研究意义．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．24
1.3国内外研究现状．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．24
材料与方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．25
2.1材料来源．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．26
2.2银杏基因组数据库的构建．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．27
2.3R2R3MYB基因家族的鉴定与分类．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．28
2.3.1序列比对．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．29
2.3.2结构域分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．29
2.3.3基因结构分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．30
2.4基因表达分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．32
2.5生物信息学分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．33
2.5.1功能预测．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．