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高级分子遗传学考试复习参考题纲
概念解释:
PDT
噬菌体展示技术(phage displayed technology,PDT)是将外源蛋白或多肽与噬菌体外壳蛋白融合,展示在噬菌体表面并保持特定的空间构象,利用特异性亲和作用以筛选特异性蛋白或多肽的一项新技术。该技术将基因型与表型、分子结合活性与噬菌体的可扩增性结合在一起,是一种高效的筛选新技术。目前已成功应用于抗原表位分析,单抗筛选,蛋白质功能拮抗多肽或模拟多肽的确定等。DNA shuffling
将不同品系具有不同突变位点的基因(1~6kb)或同一家族的基因混合,用DNase I酶切构成随机DNA片段库(Pool)。用此库样品为模板、以小分子引物进行PCR扩增,一些随机模板得到扩增,由于片段间存在同源性,在退火过程中常出现模板转换(switch),从而有可能出现集多种突变点于一个基因上的DNA分子,可从多种多样的重组分子中筛选出有用基因。
卫星RNA(satellite RNA)
类病毒(viroids)和拟病毒(virusoids)中类病毒是有侵染性并能独立作用的RNA分子,没有任何蛋白质外壳。拟病毒在构成上与类病毒类似,但是被植物病毒包装,与一个病毒基因组包被在一起。拟病毒不能独立复制,需要病毒帮助其复制。有时拟病毒又称为卫星RNA(satellite RNA)。
交换固定(crossover fixation)
指某一基因簇中的突变通过不等交换趋向扩展到整个基因簇的现象。结果突变的基因要么被淘汰,要么占据全部原来相同基因的位置。
分子伴侣(chaperone)
一种能诱导靶蛋白质形成特定构象使其正确组装的蛋白质。
空转反应(idling reaction)
当空载tRNA进入A位点时,核糖体产生pppGpp 和ppGpp, 诱发应急型反应。AARS:(氨酰-tRNA合成酶)
催化氨基酸和tRNA2‘或3’-OH共价连接的酶AARS分为I、II型两组。I 型:Arg、Gln、Glu、Ile、Leu、Trp、Tyr、Val、Cys-RS,其余为II型。I 型RS含有HIGH签名序列(His-Ile-Gly-His)和KMSKS(Lys-Met-Ser-Lys-Ser)序列,使AA结合在3(A的2(-OH上,可以在2(、3(之间移动。II型RS无签名序列,而有3个保守基序。
RNAi/RNAq (RNA干扰、RNA压制(PTGS),在动物中被称为RNA干扰(RNA interference, RNAi),在真菌中则被称为RNA压制(RNA quelling,RNAq)。尽管叫法不同,但都具有相似机制,都启动一种特殊的RNA降解过程。
酸性面条(negative noodle)
激活结构域的氨基酸序列差别较大,但要求高密度的负电荷(酸性氨基酸),即所谓“酸性面条”或“酸球”。
分枝迁移(branch migration):
两条DNA分子之间形成的交叉点可以沿DNA移动,称为分枝迁移。分枝迁移其实是两条DNA分子之间交叉的同源单链相互置换的结果。
gRNA(向导RNA)
能与待编辑的RNA配对,提供编辑模板信息的RNA(50-70bp)称为向导RNA (gRNA)。gRNA是一种反式作用方式。待编辑RNA与向导RNA在待编辑区域的两侧进行配对,向导RNA为尿嘧啶的插入提供模板。插入后的mRNA与向导RNA完全互补。主要发生在锥虫、和动物线粒体中。
iDNA
SV40复制原点起始时,DNA聚合酶α引发体起始DNA的合成,起始
反应非同寻常:从RNA开始,但是引物由DNA聚合酶活性来延伸,提供一个短的(3-4个碱基)的DNA序列,成为iDNA即initiator DNAtRNA (suppressor tRNAs)
tRNA结构基因由于抑制基因的突变而产生的变异tRNA,叫做抑制基因tRNA,一般代表无义抑制基因。当与某种氨基酸相对应的tRNA基因有数个时,抑制基因tRNA多数是由于其中一个tRNA基因发生突变,通常是在tRNA的反密码子部位中发生一个碱基置换,因而它能与无义密码子相对应。偶尔也有因反密码子以外的部位发生变化而成为抑制基因tRNA的。所以抑制基因tRNA决定着哪一种氨基酸可以插入到与无义密码子相对应的部位上去。
MAR (基质附着区,也称支架附着区SAR)
DNA中与细胞核基质附着的区域。富含AT,无共有序列。
孪生内含子(twintron)
内含子定义为基因中间插着的若干段序列,在RNA转录物水平上经剪接除去,不参与该基因在蛋白质水平上的表达。细胞器RNA孪生内含子? ? ? ?? ?? ?? ?? ?? ?
流产起始(abotive initiation):
在RNA伸长到9-10个核苷酸以前,形成的三元复合物并不稳定。体外试验表明,
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