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中文摘要
生物标志物WASH7P与肝癌预后及与免疫浸润的相关性
摘要
背景:原发性肝癌(PrimaryLiverCancer,PLC)是一种致命的
恶性肿瘤,是全球癌症相关死亡的第四大原因,具有明显的组织学和
生物学异质性。然而,肝癌潜在的分子生物学机制尚未阐明。本研
究旨在应用生物信息学分析来识别与肝细胞癌生物发生相关的关键
基因并揭示潜在的分子机制。
方法:肝癌数据集来自癌症基因组图谱(TheCancerGenomeAtlas,
TCGA)数据库,用于识别肝癌中的差异表达基因(differentially
expressedgenes,DEG)。采用基因本体(geneontology,GO)功能
注释、京都基因与基因组百科全书(Kyotoencyclopediaofgenes
genomes,KEGG)通路分析和基因集富集分析(genesetenrichment
analysis,GSEA)对DEG进行功能富集分析。ssGSEA用于基因集
富集分析(Genesetenrichmentanalysis,GSEA),以研究核心基因与
免疫细胞之间的相关性。肝癌患者数据集来自TCGA数据库,用于计
算核心基因RiskScore的最佳截断值。通过应用Logstic回归分析和Cox
回归分析构建预后模型,采用KM分析和ROC曲线评价预后模型的预
测能力。
结果:总共鉴定出838个差异表达基因。794个高表达,44个低表
达。其中,WASH7P表达量与Th2细胞浸润水平呈正相关,与细胞毒
性细胞浸润水平呈负相关。Logistic回归分析表明,WASH7P高表达
预示着HCC临床病理特征较差。Cox回归分析将WASH7P确定为OS
的独立预后变量。在预测肿瘤和正常结果时,变量WASH7P的预测能
力具有一定的准确性(AUC=0.839,CI=0.783-0.894)。KM分析显示,
高危HCC患者预后较差。
结论:WASH7P是HCC的潜在的分子靶点,并与肝癌中的免疫浸
润相关。
关键词:WASH7P,肝癌,预后,免疫浸润
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英文摘要
BiomarkerWASH7PandHowItRelatesWithImmune
InfiltratesinHepatocellularCarcinoma
ABSTRACT
Background:Primarylivercancer(PLC)isafatalmalignancywith
markedhistologicalandbiologicalheterogeneity,andisthefourthleading
causeofcancer-relateddeathsworldwide.However,theunderlying
molecularbiologicalmechanismshavenotbeenelucidated.Thisstudy
aimstoapplybioinformaticsanalysistoidentifykeygenesassociatedwith
thebio-genesisofhepatocellularcarcinomaandrevealtheunderlying
molecularmechanisms.
Methods:ThelivercancerdatasetsareobtainedfromTheCancer
GenomeAtlas(TCGA)usedtoidentifydifferentia