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法医DNA提取方法
Chelex-100法:
原理:
Chelex是一种以亚氨二乙酸为吸附因子的苯乙烯与二乙基苯的共聚物,对多价金属离子有螯合作用,可防止DNA在煮沸加热前被降解,同时在高温低离子强度下还有催化DNA释放的作用。这样既可减少DNA的损失,又可削除扩增中的一些抑制因素。
Chelex-100法:
优点:快速、方便,且仅在一个管内进行, 减少污染
缺点:DNA提取的浓度小,对检材条件要求较高,对被泥土、石灰粉、染料污染的检材效果不佳,常导致扩增效率下降或失败。
Chelex-100法:
所取全血与DNA含量之间的关系:
全血(ul) 理论DNA 产量(μg)
1 0.04~0.06
10 0.2~0.4
100 2~4
200 4~6
400 8~10
Chelex-100法:
注意事项:
A.核膜和其它试剂一起保留下来了,DNA纯度比有机溶剂提取法低;
B.chelex-100法将DNA双螺旋打开,不能用像EB染料插入方法进行定量,只能用杂交方法定量;
C.由于沸水浴8min和快速振荡使DNA片段受到损害而断裂,对于大于500bp的片段扩增成功率低。
D.chelex-100在配置数小时后螯合能力就有下降趋势,将会导致提取的DNA溶液中有各种金属离子或抑制剂,对PCR反应可能有影响。
酚/氯仿/异戊醇法
原理:
通过酚-氯仿混合物萃取 DNA溶液中的蛋白质类有机物质,而保留 DNA 于水相溶液 中。
优点:
适用所有生物检材,提取 DNA 分子结 构完整,特别适合 RFLP、测序等需要大分子 DNA分析技术。
酚/氯仿/异戊醇法
缺点:操作步骤复杂,需要多次更换离心管,容易交叉污染;
注意事项:
a. 操作中注意避免交叉污染;
b. DNA得率较低,不适合微量DNA检材;
c. 操作的误差所可能残留的成分可能抑制PCR反应,各种成分对PCR的抑制作用如下:
几种盐类对PCR的抑制浓度:
盐析法:
原理:利用6M的NaCl或醋酸钠沉淀蛋白质代替有机酚-氯仿抽提步骤去除蛋白质,其他过程同有机溶剂提取法。
优点:操作简单,步骤少,不使用有毒害的化学试剂酚和氯仿
缺点:得到的DNA盐浓度较高,对下游的PCR反应影响较大
.磁珠法 :
原理:
利用磁性硅胶吸附白细胞,用细胞裂解液裂解细胞,从细胞中游离出来的DNA分子被吸附到磁性颗粒表面,蛋白质等分子不被吸附而留在溶液中。在磁场作用下,磁性颗粒与液体分开,回收颗粒,再用纯水或TE洗脱吸附的DNA。
磁珠法:
优点:
不需要离心,操作简单;
在同一个反应管内提取,没有样品的损失,更适合于自动化提取;
与chelex-100提取法相比,磁珠法回收率高,即使是0.5μl血仍能得到DNA分型而用chelex-100提取同样量的血DNA有时不能得到分型。
硅珠法:
原理:
在高浓度的硫氰酸胍的存在下,DNA被二氧化硅特异性的吸附,被吸附的DNA在没有硫氰酸胍存在下,DNA又从二氧化硅释放出来,硫氰酸胍是高性能的蛋白变性剂,可以使蛋白质与DNA分离,在硅珠吸附前高速离心可以将变性的蛋白质等不溶物除去,吸附后的漂洗可将溶液中的PCR抑制物除去。
硅珠法:
优点:
提取的DNA比较纯,回收率高,可以从0.5μl的血液中提取到足以进行PCR反应的DNA。
FTA技术
FTA技术的核心是一种专利化合物,FTA卡片预先被此种化合物浸透,当血液与FTA卡接触后,细胞膜被裂解,蛋白质发生变性,DNA分子则被捕获并与载体牢固结合,而且FTA卡片上的DNA可在室温下长时间稳定保存,FTA卡可保护其上的DNA免受核酸酶、氧化作用、紫外线、细菌和真菌的影响,生物检材中可能存在的病原体与FTA卡接触后也将失活。 保存的DNA可以方便快捷的进行纯化和洗脱。
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