SZDBZ 124-2015 基于第二代测序技术的HLA高分辨分型检测标准.docx
ICS11.100.C63
SZDB/Z
深圳市标准化指导性技术文件
SZDB/Z124-2015
基于第二代测序技术的HLA高分辨分型检测标准
2015-02-05发布2015-03-01实施
深圳市市场监督管理局发布
SZDB/Z124-2015
I
目次
前言 II
1范围 1
2缩略语 1
3术语和定义 1
4检测工作程序 2
5实验室工作程序 4
6检测报告 5
7受检者资料和样本的保存 5
8质量控制 5
附录A（资料性附录）基于第二代测序技术的HLA高分辨分型检测送检单 6
附录B（资料性附录）基于第二代测序技术的HLA高分辨分型检测报告单 8
参考文献 9
SZDB/Z124-2015
II
前言
本标准按照GB/T1.1—2009给出的规则起草。
请注意本文件的某些内容可能涉及专利。本文件的发布机构不承担识别这些专利的责任。本标准由深圳市卫生和人口计划生育委员会归口。
本标准负责起草单位：深圳华大基因医学有限公司、深圳华大临床检验中心。本标准主要起草人：姜丹、陈仕平、李云、陈李鑫。
本标准为首次发布。
SZDB/Z124-2015
1
基于第二代测序技术的HLA高分辨分型检测标准
1范围
本标准规定了基于第二代测序技术的HLA高分辨分型的检测对象、受检者资料和样本的采集、实验室工作程序、检测报告、受检者资料和样本的保存、质量控制的要求。
本标准适用于使用第二代测序技术进行HLA高分辨分型检测的机构，对外周血、脐血、口腔拭子或全基因组DNA进行基于第二代测序技术的HLA高分辨分型检测。
2缩略语
下列缩略语适合于本标准。bp：碱基对（basepair）
DNA：脱氧核糖核酸（DeoxyribonucleicAcid）RNA：核糖核酸（RibonucleicAcid）
HLA：人类白细胞抗原（HumanLeukocyteAntigen）HTS：高通量测序（High-throughputsequencing）
NGS：第二代基因测序技术（NextGenerationSequencing）PCR：聚合酶链反应（PolymeraseChainReaction）
Q-PCR：定量聚合酶链反应（QuantitativePolymeraseChainReaction）dNTP：脱氧核糖核苷三磷酸（deoxy-ribonucleosidetriphosphate）
SBT：基于基因测序的分型法（SequencingBasedTyping）
SNP：单核苷酸多态性（SingleNucleotidePolymorphisms）SSP：特异性序列引物（SpecificSquencePrimer）
A：腺嘌呤（Adenine）
T：胸腺嘧啶（Thymine）G：鸟嘌呤（Guanine）
C：胞嘧啶（Cytosine）U：尿嘧啶（Uracil）
Sanger：双脱氧链终止法
3术语和定义
下列术语和定义适用于本文件。
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3.1HLA基因
人类白细胞抗原基因，其编码基因位于人类16号染色体短臂，长约3600KB，根据功能和产物结构的不同，分成3组：经典HLA基因、免疫功能相关基因和免疫无关基因。其中经典HLA基因与输血和移植急性排斥反应密切关联。因此，对于经典的HLA基因进行分型在临床上有重要意义。
3.2HLA高分辨分型
即从基因序列水平对HLA进行分型的技术，其结果精确到血清学水平后的亚型。HLA高分辨分型与过去的低分辨分型相比配型速度更快，配型更精确，使得移植排斥反应更小，手术成功率和术后存活率更高。
3.3第二代测序技术
基于第一代sanger测序技术、利用边合成边测序原理，通过捕捉新合成的末端的标记来确定
DNA序列的一种新的测序技术，在Sanger等测序方法的基础上，通过技术创新，用不同颜色的荧光标记四种不同的dNTP，当DNA聚合酶合成互补链时，每添加一种dNTP就会释放出不同的荧光，根据捕捉的荧光信号并经过特定的计算机软件处理，从而获得待测DNA的序列信息。第二代测序技术具有通量高、成本低等特点，能一次并行对几十万到几百万条DNA分子进行序列测