WGCNA技术在甘蔗细胞壁建成和糖分积累调控网络中的应用研究.docx
WGCNA技术在甘蔗细胞壁建成和糖分积累调控网络中的应用研究
目录
WGCNA技术在甘蔗细胞壁建成和糖分积累调控网络中的应用研究（1）
一、内容概览．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．4
（一）研究背景．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．5
（二）研究意义．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．6
（三）研究内容与方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．7
二、甘蔗细胞壁建成与糖分积累概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．8
（一）甘蔗细胞壁的结构与功能．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．12
（二）甘蔗糖分积累的生理机制．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．13
（三）WGCNA技术简介．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．14
三、基于WGCNA技术的甘蔗基因表达谱分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．16
（一）数据收集与处理．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．17
（二）相似度计算与聚类分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．18
（三）关键基因筛选与鉴定．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．21
四、WGCNA技术在甘蔗细胞壁建成调控网络中的应用．．．．．．．．．．．．．22
（一）细胞壁成分合成相关基因的调控分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．23
（二）细胞壁结构与功能相关基因的调控分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．25
（三）基因调控网络构建与解析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．28
五、WGCNA技术在甘蔗糖分积累调控网络中的应用．．．．．．．．．．．．．．．29
（一）糖酵解途径相关基因的调控分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．30
（二）糖异生途径相关基因的调控分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．31
（三）糖分转运与储存相关基因的调控分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．33
六、WGCNA技术在甘蔗基因调控网络中的应用验证．．．．．．．．．．．．．．．35
（一）实验验证方法介绍．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．36
（二）实验结果与分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．37
（三）验证结果的意义与局限性．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．39
七、结论与展望．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．39
（一）主要研究结论总结．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．40
（二）未来研究方向与挑战．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．42
（三）对甘蔗种植产业的贡献与价值．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．43
WGCNA技术在甘蔗细胞壁建成和糖分积累调控网络中的应用研究（2）
一、研究背景与意义．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．44
甘蔗产业的重要性．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．45
WGCNA技术在植物生物学中的应用．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．46
细胞壁建成与糖分积累的关系．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．49
二、文献综述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．50
WGCNA技术概述及其发展．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．51
甘蔗细胞壁建成研究现状．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．52
糖分积累调控网络研究进展．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．53
三、研究方法与材料．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．55
实验材料准备与处理．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．60
WGCNA技术流程．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．61
生物信息学分析方法．．．．．．．．．．．．