博士研究生课高级生物化学与分子生物学专题生物大分子相互作用李恩民.ppt

structural and functional integration * For 2009’s Doctors BioMacroMolecular InterActionology Biommialogy 生物大分子相互作用学 Enmin Li Proteins, Proteomics RNAs, RNomics Lipids, Lipomics Biomoleculars and it’s interaction 生物分子及其相互作用 Others, Otheomics DNAs, Genomics Saccharides, Sacchariomics Figure 12.39 16S rRNA in E. coli 1542 nt, 90 loop 21 protein Ribosome mRNA+tRNA+rRNA+Protein Collagen-?1(Ⅳ) C N Collagen-?1(Ⅳ) in glomerular basement membrane Poly(Gly-Pro-Pro) in tropocollagen G P P G P P G P G P P G P P G P G P P G P P P P HO 来自于日常生活的启示-1 门的启示 A B C E 在一个相对独立的功能体中，各种活动性功能组件往往是后来逐步加上去或加工完成的。 功能体上的每一个关键组件所处的位置，以及各位置之间的相互关系是高度协调的，合理的，与整个的功能体的功能的发挥相一致。 功能体上的关键组件是随环境变化，不断向前发展变化的。 D (Adenosine diphosphate ribose) ADP-ribosylation of Gsαby cholera toxin. Lysine ?-Hydroxylysine N-Acetyllysine Hydroxylase Acyltransferase ?-N-Methyllysine Methylase ?-N,N-Dimethyllysine ?-N,N,N-Trimethyllysine Methylase Methylase Modification of Lysine Figure 1.5 -CH3 -CH3 methylation CpG island coding region 来自于日常生活的启示-2 目的地、方向指示与信号辨认 共同规则的制定、遵守与维护 违规现象与规则修改 信号灯的启示 Cell signal transduction web 9 7 5 3 1 9 7 5 3 来自于日常生活的启示-3 汽车修理工具：扳手与套筒的启示 A B C F G H J I L K N M D E 扳手：传力器/信号转导 各种形式的套筒接头，一种特殊形式的扳手的一部分，克服空间位阻障碍，使许多不可能的过程变为可能，化繁为简。 P P P P P P P P Y579 Y581 Y716 Y740 Y751 Y771 Y1009 Y1021 P85 Src Grb2 GAP PLC? SH-PTP-2 PDGF-? (platelet derived growth factor ?) receptor Kinase insert domain Kinase domain Grb2：Adapter GAP：GTPase activating protein PLC?：PLC gamma SH-PTP-2：Phosphatase-2 P85：PI3K subunit Src：Kinase For examples SH3 SH3 SH3 SH3 SH3 SH2 SH2 SH2 SH2 SH2 SH2 SH1, tyrosine kinase Phospholipase C Phospholipase C GTPase activating protein Src Grb2 GAP PLC? 1 1 ME AIAKY*DF*KATADDE*LSFKRGDILKVLNEECDQN 36 W*YKAELNGKDGFIP*KNY*IE MKPH PWFFGKIPRAKA 71 EEMLSKQRHDGAFLIRESESAPGDFSLSVKFGNDV 106 QHFKVLRDGAGKYFLWVVKFNSLNELVDYHRSTSVS0R 143 NQQIFLR DIEQVPQQPT YVQALF*DF*DPQEDGE*LGFRRG 181 DFIHVMDNSDPNW*WKGACHGQTGMFP*RNY*VTP VNRNV Primary structure of Grb2 protein SH3 -3 SH3