毒蕈乙酰胆碱受体亚型关系的研究_于海龙.pdf

DOI:10.16288/j.yczz.2007.10.009 HEREDITAS (Beijing) 2007 年 10 月, 29(10): 1280―1288 ISSN 0253-9772 研究报告 DOI: 10.1360/yc-007-1280 毒蕈乙酰胆碱受体亚型关系的研究 于海龙 1, 肖云 1, 艾静 2, 李霞 1,2,3, 宫滨生 1 1. 哈尔滨医科大学生物信息学系, 哈尔滨 150086; 2. 黑龙江省生物医药重点实验室, 哈尔滨 150086; 3. 首都医科大学生物医学工程学院, 北京 100054 摘要: 利用不同类型的生物学数据, 运用生物信息学方法和策略, 从分子进化、序列相似性、表达相关性以及 蛋白互作 4 个层面对 M 受体亚型之间的关系进行了比较全面的研究。分析表明, 从分子进化和序列相似性角度, 毒蕈乙酰胆碱受体 5 种亚型可分为 2 个亚类,分别为 M1、M3、M5 亚类(第一亚类)与 M2、M4 亚类(第二亚类), 每一亚类内部亚型之间进化距离相对较近, 序列相似性较高。在表达层面发现第一亚类中受体亚型与第二亚类 中受体亚型在某些组织中正表达相关, 呈现共表达趋势。在互作层面发现两亚类之间受体亚型存在着间接互作 的关系, 呈现协同作用的现象。 关键词: 毒蕈乙酰胆碱受体; 亚型; 分子进化; 表达相关性; 蛋白质互作 Relationship between muscarinic acetylcholine receptor subtypes YU Hai-Long1, XIAO Yun1, AI Jing2, LI Xia1,2,3, GONG Bin-Sheng1 1. Department of Bioinformatics, Harbin Medical University, Harbin 150086, China; 2. Bio-Pharmaceutical Key Laboratory of Heilongjiang Province, Harbin 150086, China; 3. Biomedical Engineering Institute of CUMS, Beijing 100054, China Abstract: Muscarinic acetylcholine receptor belongs to the G-coupled receptor family, the cooperation between its five subtypes is crucially important in maintaining the normal physiological function. At present, many types of biological re- sources are increasing, which provides unprecedented opportunities to study the relationships between muscarinic acetyl- choline receptor subtypes. In this study, we take advantage of different types of data, using bioinformatics tools and strate- gies, to anal