GenBank数据库检索及其应用.pptx
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简介;NCBI网站网址:
;GenBank和PubMed(序列数据)检索的比较:;检索界面;;;;;跨库检索界面:;;;;;;核苷酸序列数据库检索界面:;简介;简介;检索限定词:;;简介;特殊标志符的格式(核酸序列) :;(1)mRNA 记录(NM_*):
e.g.:NM_000492
(2)基因组DNA重叠群(NT_*):
e.g.:NT_000347
(3)完整的基因组或染色体(NC_*):
e.g.:NC_000907
(4)基因组的局部区域(NG_*):
e.g.:NG_000019
(5)从人类基因组序列注释、加工得到的序列模型记录(XM,XP,or XR_*):
e.g.:XM_000483;特殊标志符的格式(核酸序列):;;;简介;;第28页/共117页;简介;;第31页/共117页;简介;范围检索:中间用冒号连接;简介;限制检索;简介;限制检索界面:;;核苷酸序列数据库分为三个子数据库:;;核苷酸序列数据库检索界面:;;限制检索界面:;;;限制检索范围;限制检索范围;;;限制分子类型;限制分子类型; 限制基因位点; 限制基因位点;限制序列片段的显示;限制序列片段的显示;限制数据来源;限制数据来源;限制数据修订日期;限制数据修订日期;;简介;;预检索/索引检索界面:;;;第66页/共117页;第67页/共117页;;;ras[GENE];;;;;;简介;penicillin-binding;;mycobacterium tuberculosis;;;;#8 AND #4;;penicillin-binding AND mycobacterium tuberculosis[ORGN];简介;检索结果显示界面:;;选择检索结果的显示格式;;第91页/共117页;摘要格式:;第93页/共117页;Genbank 格式:;Genbank 格式:;Genbank 格式:;Genbank 格式:;Genbank 格式:;Genbank 格式:;Genbank 格式:;Genbank 格式:;GenBank记录中特性表中的主要关键词:;关键词;关键词;关键词;限定词;限定词;限定词;限定词;FASTA格式:;图解显示:;图解显示:;序列修订记录:;序列修订记录:;序列修订记录:;序列修订记录:;谢 谢!
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