类病毒检测技术培训于德才.ppt

1 2 3 4 核酸斑点杂交（NASH）技术的研究 探针的制备 2、引物筛选 根据已报导的PSTVd基因序列（Genebank登陆号AY372400）设计两对引物对7Z质粒上的PSTVd单体目的片段进行PCR扩增 引物Ⅰ(PrimerⅠ):片段大小为154 bp P(c):5‵CGA AGC CGA TGA T3‵与261-249互补 P(H): 5‵GGA ATA ACG3‵与124-116同源 引物Ⅱ(Primer Ⅱ): 片段大小为309bp P(c): 5‵TGG AGG ACT CG T3‵与47-37互补 P(H): 5‵GGA ATA ACG 3‵与124-116同源 * * 样品采自大庆地区，样品为克新13号 二、类病毒种类 已知序列类病毒种类及其分类 The variants of viroid known sequence and their classification 中名 Chinese names 英名 English names 缩写 Abbrevia-tion 大小 Length (nt) 中央保守区 Central conserved 马铃薯纺锤块茎类病毒 Potato spindle tuber PSTVd 356-360 PSTVd 柑桔裂皮类病毒 Citrus exocortis CEVd 370-375 PSTVd 菊花矮化类病毒 Chrysanthemum stunt CSVd 354-356 PSTVd 番茄顶矮化类病毒 Tomato apical stunt TASVd 360-363 PSTVd 番茄雄性株类病毒 Tomato planta macho TPMVd 360 PSTVd 唇膏蔓蔷薇隐性类病毒 Columnea latent CLVd 370-372 PSTVd 啤酒矮化类病毒 Hop sturt HSVd 297-303 PSTVd 椰子死亡类病毒 Coconut cadang-cadang CCCVd 246-247 CCCVd 椰子tinangaja类病毒 Coconut tinangaja CTiVd 254 CCCVd 啤酒花隐潜类病毒 Hop lalent HLVd 256 CCCVd 柑桔IV类病毒 Citrus IV CVdiV 284 CCCVd 苹果锈果类病毒 Apple scar skin ASSVd 329-330 ASSVd 葡萄黄斑类病毒1 Grapevine yellow speckle 1 GYSCd1 366-368 ASSVd 葡萄黄斑类病毒2 Grapevine yellow speckle 2 GYSCd2 363 ASSVd 澳洲葡萄类病毒 Australian grapevine AGVd 369 ASSVd 柑桔硬叶类病毒 Citrus bent leaf CBLVd 318 ASSVd 梨疱溃疡类病毒 Pear blister canker PBCVd 325 ASSVd 鳄梨白斑类病毒 Avocado sunblotch ASBVd 245-250 ASBVd 桃潜花叶类病毒 Peach latent mosaic PLMVd 336-337 ASBVd 锦学苏类病毒 Coleus blumei I CbVd1 248 CbVd1 ? 类病毒结构示意图 The structure of viroid 马铃薯纺锤块茎类病毒热变性过程 Heat-denatured process diagram of PSTVd 三、类病毒结构 马铃薯纺锤块茎类病毒的五个功能区 The five functional domains of PSTVd 马铃薯类病毒中国分离株核苷酸序列 ┌25 11 1 359 1???????? CCTGCACGTC GACGATTGGA GCTC ACAGGA ACCACGAGTT TAGTTCCG