中山大学分子生物学_复习总结.doc

1. 原核基因组与真核基因组（prokaryotic genomes and eukaryotic genomes） 大小（size）：原核生物的一般都比较小，且变化范围也不大（最大/最小约为20）。 真核生物的一般要比原核生物的大很多，且变化范围也很大（最大/最小可达8万） 基因结构（gene structure: continuous coding sequences, split genes） 原核基因组：环状，较小；通常由单拷贝或低拷贝（low-copy）的DNA序列组成；基因排列紧密，较少非编码序列 —— “streamlined” 真核基因组：多线状；大小一般要比类核基因组大好几个数量级，且变化范围很大；有大量的非编码序列（重复序列、内含子等） 非编码序列（non-coding sequences: repeated sequences, introns） 局部分布的重复序列（localized repeated sequences）：串联式（tandem）的高度重复序列（highly repeated sequences）：重复单位的长度从几bp到几百bp，可重复几十万次或更多，常见于着丝粒、端粒和异染色质区域 散布的重复序列（dispersed repeated sequences）： 短的散布式重复序列（short interspersed elements, SINEs）：500 bp以下，可重复10^5次或更多，很多SINEs都是反转录转座子（retroposon）；长的散布式重复序列（long interspersed elements, LINEs）：5 kb以上，可重复10^4次或更多，很多LINEs也是与反转录转座子相关的序列 内含子（intron）：I 类（group I intron）、II 类（group II intron）、III 类（group III intron）、核mRNA内含子（nuclear mRNA intron），即剪接体内含子（spliceosomal intron）、核tRNA内含子（nuclear tRNA intron）、古细菌内含子（archaebacterial intron） 细胞器基因组（organelle genomes: mitochondrial genomes, chloroplast genomes） 线粒体基因组：在不同类型的生物中变化很大 多细胞动物：细小、致密，没有或很少非编码序列 高等植物：复杂、不均一，比动物的大得多 原生动物、藻类、真菌：或偏向于动物型，或偏向于植物型，但又有其各自的独特之处 叶绿体基因组： 比较均一，85 ~ 292 kb（大部分都在120 ~ 160 kb之内） 2. 转录（transcription） （1）RNA聚合酶（RNA polymerase） 原核生物：1种，全酶（holoenzyme）由核心酶与(亚基组成，(亚基的作用 真核生物：3种，由多个亚基组成 cis- 顺式、同一分子 trans- 反式、不同分子 in vivo 体内、细胞内 in vitro 体外、无细胞体系 in situ 原位 in silico 基于生物信息学的研究体系 sense strand有义链）= nontemplate strand antisense strand（反义链）= template strand （2）顺式作用元件与反式作用因子（cis-acting elements and trans-acting factors） 启动子（promoters）、增强子（enhancers）为顺式作用元件 原核启动子：-10 box (Pribnow box), -35 box 真核启动子：I类， II类，III类 RNA聚合酶I识别的启动子（I类启动子，class I promoters） RNA聚合酶II识别的启动子（II类启动子，class II promoters） RNA聚合酶III识别的启动子（III类启动子，class III promoters） 增强子：较多在真核生物中存在；能增强转录的元件，但又不是启动子的一部分（无位置、方向的限制），增强子常在启动子的上游，但也可以在基因内部（如内含子中） 转录因子（transcription factors）为反式作用因子，真核基因的转录需反式作用因子 通用转录因子能使聚合酶结合到启动子上，形成预起始复合物（preinitiation complex），包括形成开启的启动子复合物（open promoter complex），但只能导致基础水平的转录 通用转录因子： I类， I