Linux高性能计算集群配置.pdf

Linux高性能计算集群配置 李会民 hmli@ 中国科学技术大学超级计算中心 2016-5-27 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 李会民 (中国科大超算中心) Linux高性能计算集群配置 2016-5-27 1/107 内容 1 高性能计算、超级计算、并行计算 2 Linux在高性能计算领域的现状 3 NFS ：网络文件系统 4 NIS ：网络信息服务 5 quota ：磁盘配额 6 kickstart ：网络批量系统安装 7 ssh免输密码访问 8 NTP ：网络时间服务 9 内网客户端访问外网 10 FTP服务 11 安全 12 集群批量设置 13 编译环境 14 作业调度系统 15 集群监控Ganglia 16 出错时处理 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 18 联系信息 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 李会民 (中国科大超算中心) Linux高性能计算集群配置 2016-5-27 2/107 高性能计算、超级计算、并行计算 高性能计算(HPC) 指通常使用很多处理器（作为单个机器的一部分） 或者某一集群中组织的几台计算机（作为单个计算资源操作）的计 算系统和环境。有许多类型的HPC系统，其范围从标准计算机的大 型集群，到高度专用的硬件。大多数基于集群的HPC系统使用高性 能网络互连，比如那些来自InfiniBand或Myrinet 的网络互连。基本 的网络拓扑和组织可以使用一个简单的总线拓扑，在性能很高的环 境中，网状网络系统在主机之间提供较短的潜伏期，所以可改善总 体网络性能和传输速率。 一般不区分高性能计算、超级计算、并行计算之间的差别。 (a) 广州超算：天河-2 (b) 天津超算：天 (c) 深圳超算：曙光 (d) 济南超算：神威 河-1A 星云 蓝光 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 李会民 (中国科大超算中心) Linux高性能计算集群配置