基于UniGene的整合系统-运筹学与控制论专业论文.docx

AbstractOne Abstract One of the subject pMd c]ose attention of of the the research of the function．1lowever，high—quality cDNA i foundation of carrying gene function research．In recent large number of laboratories have cDNA sequence and EST sequent however，because the quality of EST is usually relatively lov for examp】e contain carrier sequence，contain non—standard base，ev( compose genet iC fragment gomphosi8 body because of experiment reasom they lead the fact that questions exist in the concatenatiOn of cDNA based EST sequence．Even it already have cDl in databases that the situation inferior iO quality existS especiallY open read frame misplace．So need of schemes optimiz hadlY S01ve thiS problem，in order solve thiS question，we pc forward iS based high quality genome sequences revise EST sequences，and confirmed the validity of thiS scheme by testing UniGeT database．i detailS，we EST sequences with genome I reviSion BLAST Linux operating get high qua]itY cDNA database，Phrap should be used assemblY EST sequences．it provide hi{ quality for research of alternativelY splice． Key word：BioinformatiCS，complementary DNA，expressed tag(ES sequence assemblY，alternatively splice II 独创性声明本人声明所呈交的论文是我个人在导师指导下进行的研究工作及 独创性声明 本人声明所呈交的论文是我个人在导师指导下进行的研究工作及 取得的研究成果．尽我所知，除了文中特别加以标注和致谢的地方外， 论文中不包含其他人已经发表或撰写过的研究成果，也不包含为获得 北京工业大学或其它教育机构的学位或证书而使用过的材料．与我一 同工作的同志对本研究所做的任何贡献均已在论文中作了明确的说明 并表示了谢意． 签名：李砉孝 日期：，芝幺≤z 关于论文使用授权的说明 本人完全了解北京工业大学有关保留、使用学位论文的规定，即： 学校有权保留送交论文的复印件，允许论文被查阅和借阅；学校可以 公布论文的全部或部分内容，可以采用影印、缩印或其他复制手段保 存论文． (保密的论文在解密后应遵守此规定) 签名：李未孚 导师签名： 躯萎基日期：旦竺，‘：兰 弟1荦绪诧第1章绪论 弟1荦绪诧 第1章绪论 1 1概述 随着生物科学技术的不断发展，研究数据迅速积累。获取，储存，处理和 分析生物学及相关信息的方法与工具亟待更新。近年来开展的各种基冈组计划， 列数抛的分析与利用提出了更高的要求，生物信息学应运而生。 ，卜物信息学是在数学、计算机科学和生命科学的基础上形成的一门新型交 叉学科，它是指为理解各种数据的生物学意义，运用数学、计算机科学与生物 学手段进行生物信息的收集、加工储存、传播、分析与解析的科学。最近几年 随着快速序列的测定、綦因重组、多维核磁共振等技术的应用，生物学实验数 圳挚爆炸趋势增长，随之计算机和国际互联网络的发展使得对大规模数据的贮 存、处理和传输成为可能。同时生物信息学作为10]新的学科领域，它是将基 吲组DNA序列信息分析作为源头，在获得了蛋白质编码区的信息之后进行蛋白 质空间结构模拟和预测，然后依据特定蛋白质的功能进行必要的药物设计。它 由相Ⅱ依赖、相互渗透的两个研究领域组成，即构筑现代生