《青岛菲律宾蛤仔ITS序列遗传多样性分析》-毕业论文（设计）.doc

学 士 学 位 论 文 题目：青岛菲律宾蛤仔ITS序列遗传多样性分析 姓名 院系 生命科学学院 专业 生物工程 年级 学号 指导教师 2011年5月20日 目 录 TOC \o 1-3 \h \z \u HYPERLINK \l _Toc294871691 1.实验背景 PAGEREF _Toc294871691 \h - 1 - HYPERLINK \l _Toc294871692 2.材料方法 PAGEREF _Toc294871692 \h - 3 - HYPERLINK \l _Toc294871693 2.1.实验材料 PAGEREF _Toc294871693 \h - 3 - HYPERLINK \l _Toc294871694 2.1.1.样品采集 PAGEREF _Toc294871694 \h - 3 - HYPERLINK \l _Toc294871696 2.1.2.备用溶液配制 PAGEREF _Toc294871696 \h - 3 - HYPERLINK \l _Toc294871697 2.2.DNA的提取 PAGEREF _Toc294871697 \h - 3 - HYPERLINK \l _Toc294871698 2.2.1.取样 PAGEREF _Toc294871698 \h - 3 - HYPERLINK \l _Toc294871699 2.2.2.消化组蛋白 PAGEREF _Toc294871699 \h - 3 - HYPERLINK \l _Toc294871700 2.2.3.蛋白沉淀 PAGEREF _Toc294871700 \h - 4 - HYPERLINK \l _Toc294871701 2.2.4.提纯 PAGEREF _Toc294871701 \h - 4 - HYPERLINK \l _Toc294871702 2.2.5.清洗 PAGEREF _Toc294871702 \h - 4 - HYPERLINK \l _Toc294871703 2.2.6.保存 PAGEREF _Toc294871703 \h - 4 - HYPERLINK \l _Toc294871704 2.3.PCR扩增 PAGEREF _Toc294871704 \h - 4 - HYPERLINK \l _Toc294871705 2.4.扩增产物鉴定 PAGEREF _Toc294871705 \h - 4 - HYPERLINK \l _Toc294871706 2.5.扩增产物纯化及序列测定 PAGEREF _Toc294871706 \h - 4 - HYPERLINK \l _Toc294871707 3.实验结果 PAGEREF _Toc294871707 \h - 5 - HYPERLINK \l _Toc294871708 3.1.ITS基因PCR扩增测序结果 PAGEREF _Toc294871708 \h - 5 - HYPERLINK \l _Toc294871709 3.2. ITS基因序列数据处理 PAGEREF _Toc294871709 \h - 5 - HYPERLINK \l _Toc294871710 3.3. ITS基因片段序列分析 PAGEREF _Toc294871710 \h - 8 - HYPERLINK \l _Toc294871711 4.讨论 PAGEREF _Toc294871711 \h - 9 - HYPERLINK \l _Toc294871712 参考文献 PAGEREF _Toc294871712 \h - 10 - HYPERLINK \l _Toc294871713 致谢 PAGEREF _Toc294871713 \h - 11 - 鲁东大学本科毕业论文 - 10 - - 青岛菲律宾蛤仔ITS序列遗传多样性分析 杨玉琨 （生命科学学院，生物工程，2007级工程2班，20072513295） 摘要：利用PCR特异扩增ITS序列的研究方法对青岛地区菲律宾蛤仔的遗传多样性进行分析研究。实验流程是：将采集的21只青岛地区的菲律宾蛤仔个体进行提取DNA基因，然后进行PCR法扩增核糖体DNA中的ITS序列，再进行测序并分析其遗传多样性，计算基因频率、构建系统发育树、计算遗传距离。本次实验成功扩增并测序了18个样品，核糖体DNA基因组ITS序列大小为616bp左右，各碱基的平均含量为：A占17.9%，G占31.9%，C占31.7%，T占18.6%，个体间的碱基组成差别比较小。通过与Genbank上编号 HM