生物学软件——像图处理类和序列综合分析.doc

生物学软件——图像处理类和序列综合分析 2003-10-19 21:03:00　信息来源：生物软件网　 　　生物学软件——图像处理类和序列综合分析 生物谷网站 图像处理类 ??????????? ImageTool (IT) 3.0 4兆。mageTool (IT) 3.0版是一个免费的科学用途的图像处理与分析软件，可以显示、编辑、分析、处理、压缩、打印灰度图形或彩色图形 。可打开超过22中图像格式。在生物领域，它的用途便是各种电泳胶图的分析了。只要有扫描仪，便能利用IT完成胶图的各种处理，包括注释、透光率扫描等工作。英文使用手册，650K。原始网址。 ImageJ 1.26 6.8M，包括JAVA运行环境。一个用JAVA语言写成的科学用图像处理软件,可以显示、编辑、分析、处理8位、16位、32位图像。帮助文档，410K，源代码，390K。原始网址。 Cross Checker 2.91 4.3 Mb, RFLP, RAPD 与 AFLP基因指纹图分析软件。 相应的ALF (Amersham Pharmacia) 图像格式转换软件ALFmap 1.22。28K。原始网址。 Band Leader 3.0 496 K, 凝胶图像处理软件， 为共享软件，而且注册免费。 Scion Image 4.02Beta 2.2M,是一个优秀的免费图像处理与分析工具。是非常流行的苹果机上的NIH（National Institutes of Health) Image的WINDOWS版，用来显示编辑分析各种图像。 读取格式为 TIFF 与BMP格式,是一个专业图像分析软件，适用与于科学处理，这点从研发单位便可看出。生物学工作者处理图像必备。原始网址。 OSIRIS 4.18 3.9M。是一个通用医学图像处理与分析软件。如果你是医生，试试它吧。英文使用手册，770K；中文版使用说明书（由作者杨擎授权本站），600K。原始网站。在生物软件光盘5中。 Melanie 3 Viewer 4.1M。为免费用来查看使用Melanie3软件获得的凝胶图片与相关数据，也包括一些有限的凝胶数据分析功能。原始网站。 Smart Draw 6.0 Demo 4.5M,30天全功能演示版，绘制流程图、组织图、科学绘图、表格、平面布置图非常方便。英文使用说明，1.5M，PDF格式。原始网址。 GIMPWin 1.2.3 7M。GIMPWin是符合GNU协议的图像处理自由软件，原软件是UNIX版，经人改造为Windows版，可以试试。原始网站。 ChromoZoom 1.1 207kb 这个软件是设计用来比较两个图像的相同与不同之处。 bandscan 5.0 Demo 2.2M，蛋白凝胶电泳图像分析软件30天内30次试用版，功能包括凝胶图像分析、光密度扫描、分子量计算、自动查找条带、杂点去除、电泳迁移校正功能。非常好的一个软件。原始网站。 SigmaScan Pro 5.0 Demo 12M，是一个有力的图像分析软件30天全功能演示版，进行数字图像的分析处理，可以很容易地将图像进行分析，得出科学结论。注意安装时如果说超期，把时间调回2000年。去除时间限制，参考生物软件论坛。原始网站。 SigmaGel 1.0 Demo 2.3M。凝胶图像分析软件，30天Demo版。原始网站。 TotalLab 2.0 评估版 22M 是一个图像分析软件，对DNA、蛋白凝胶电泳图像、arrays, dot blots与colonies等图像可以进行很方便的处理。应原作者的要求取消直接下载链接，大家如果要下载，请到原始网站。评估版有时间限制。使用手册，500K，PDF格式，原始网站。 LabImage 2.62 评估版 876K，德国人编写的一个凝胶图像分析软件，30天免费使用，到期后部分功能有限制。原始网站。 GelDiff 1.0 35K。是用来定量比较两个2D凝胶图像的不同之处的JAVA软件，需要先安装JDK后才能运行。原始网站。 Timediff 1.2 1.1M。是一个分析蛋白/基因表达图谱时间序列的JAVA软件,需要先安装JAVA JDK才能运行。原始网站。 QuantiScan 2.1 Demo 1.7M，使用简单功能专一的凝胶扫描、分析软件。Tigermouse用永久汉化软件制做的汉化版，欢迎大家测试。原始网站。 PDQuest 6.2.1 11M。30天试用版。是一个分析2维凝胶并生成数据库的标准软件。使用它，可以同时分析100个凝胶图像，生成包含1000个凝胶图像的数据库。使用手册，1.4M。原始网站。 digitizer 3.3 1.3 兆 图形数字化软件。可以将曲线图转化为数据与等式。当用仪表做出曲线图后，用扫描