小肽阻滞剂和纳米碳管对淀粉样肽结构和热力学性质影响的分子动力学研究的中期报告.docx

小肽阻滞剂和纳米碳管对淀粉样肽结构和热力学性质影响的分子动力学研究的中期报告 本研究旨在使用分子动力学模拟方法研究小肽阻滞剂和纳米碳管对淀粉样肽结构和热力学性质的影响。目前研究已完成了模型建立、初始构象设定、模拟参数优化、模拟计算等中期阶段工作。 首先，我们根据淀粉样肽的实验结构数据建立了淀粉样肽的原子模型。然后，根据文献报道，选择了两种小肽阻滞剂（P1和P2）和两种纳米碳管（CNT1和CNT2）作为研究对象。接着，分别将小肽阻滞剂和纳米碳管引入淀粉样肽模型中，构建了对应的复合系统模型。 在模拟参数优化方面，我们对系统温度、压力、模拟时间等参数进行了调整，保证模拟过程稳定可靠。最终，完成了各组模拟计算，得到了淀粉样肽、淀粉样肽-P1、淀粉样肽-P2、淀粉样肽-CNT1、淀粉样肽-CNT2、淀粉样肽-P1-CNT1、淀粉样肽-P1-CNT2、淀粉样肽-P2-CNT1、淀粉样肽-P2-CNT2等共9个体系在模拟过程中的构象演化和相互作用能量等信息。 目前，我们正在对模拟结果进行分析和比较，探究小肽阻滞剂和纳米碳管对淀粉样肽结构和热力学性质的影响机制。下一步，我们将进一步深入研究不同小肽阻滞剂和纳米碳管的结构差异、作用机制以及对淀粉样肽性质的调控效应，为新型淀粉样肽药物和功能纳米材料的设计提供有力支撑。