肝细胞癌发生中肝硬化差异基因表达谱的生物信息学研究的中期报告.docx

肝细胞癌发生中肝硬化差异基因表达谱的生物信息学研究的中期报告 本研究旨在比较肝细胞癌发生前后肝硬化组织的基因表达谱，筛选出差异表达的基因，揭示肝细胞癌发生和肝硬化之间的关联。本阶段主要完成以下工作： 1. 数据预处理：获取GSE16879 数据集中肝硬化和肝细胞癌病变组织的原始基因表达数据，并进行质量控制和数据清洗。 2. 基因表达分析：通过基因差异表达分析筛选出在肝硬化和肝细胞癌之间不同ially expressed 的基因，并进行聚类分析和表达谱可视化分析。 3. 生物信息学分析：利用GO和KEGG Pathway数据库分析差异表达基因的功能和相关通路，并进行基因网络分析和驱动基因预测分析。 初步结果显示，在肝细胞癌发生前后的肝硬化组织中，存在一批基因表达差异明显的基因，这些差异表达基因主要与细胞增殖、凋亡、细胞周期调控、信号转导等生物学过程有关。此外，GO和KEGG分析进一步证实这些基因的重要功能以及在肝细胞癌发生过程中的重要作用。 总体而言，本研究揭示了肝细胞癌发生前后肝硬化组织的差异表达机制，为深入探索肝细胞癌的发生机制和对其进行早期诊断和治疗提供了一定的理论和实验基础。后续将进一步完善数据分析并进行实验验证。