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盐芥蛋白质组学研究的任务书
任务书
标题:盐芥蛋白质组学研究
背景:
盐芥(BrassicajunceaL.)是一种广泛种植的油菜作物,在全球范围内都
有重要的农业和食品经济价值。同时,盐芥的营养成分也备受关注,其
中蛋白质是盐芥营养价值的重要组成部分。目前,随着蛋白质组学技术
的发展和应用,研究盐芥蛋白质组学已经成为一个热点领域。通过对盐
芥蛋白质组的研究,可以揭示盐芥蛋白质在抗逆性、营养特性等方面的
机理,从而为盐芥作物的选育和改良提供科学依据。
任务:
本次研究旨在利用蛋白质组学技术,建立盐芥蛋白质组谱库,并对其进
行分析和比较,揭示其在不同条件下的差异表达情况以及生物学功能。
具体任务如下:
1.收集盐芥不同生长时期和环境条件下的样品,包括不同组织和器官的样
品;
2.提取样品中的蛋白质,进行SDS或2-DE电泳分离,并用质谱技
术进行鉴定和分析;
3.建立盐芥蛋白质组谱库,包括蛋白质的组成、数量、结构、功能等信息,
并进行数据库管理和维护;
4.对盐芥蛋白质组谱库进行分析和比较,揭示在不同生长时期、环境条件
和组织器官等方面的差异表达情况,并进行生物学功能和途径分析;
5.利用生物信息学工具,对盐芥蛋白质组谱库进行注释和联合分析,找出
与盐芥逆境响应、营养、生长发育等相关的蛋白质,探索盐芥蛋白质组
在生物学功能上的规律性;
6.撰写研究报告,总结盐芥蛋白质组学研究的主要结果和发现,并对盐芥
蛋白质组学的应用前景进行展望。
计划时间:
本研究预计需要12个月的时间,具体时间节点如下:
月份计划任务
1-2收集盐芥样品,准备实验设计和方案
3-4蛋白质提取和SDS/2-DE电泳分离
5-6质谱鉴定和分析,建立盐芥蛋白质组谱库
7-8蛋白质组数据分析和比较
9-10生物信息学分析和挖掘
11-12撰写研究报告
预算:
本研究预算为30万元,主要用于样品收集、实验材料和设备、质谱分析
等方面的支出,具体预算分配如下:
项目预算(万元)
实验材料和设备10
样品收集和处理5
质谱分析和数据处理10
其他支出5
总计30
参考文献:
1.ZhangS,GuoL,SunH,etal.ComparativeProteomicAnalysisofthe
ResponsetoSaltStressinSalt-sensitiveandSalt-tolerantRice[J].
JournalofProteomeResearch,2011,10(8):3852-3870.
2.DongX,JinM,WenF,etal.ComparativeProteomicAnalysisofthe
ResponsetoSaltStressinMutantandWild-typeEutrema
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3.LiH,YangY,ZhangS,etal.ComparativeProteomicsAnalysis
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JournalofProteomeResearch,2016,15(1):465-476.