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地理数据库简介.ppt

发布:2017-07-05约小于1千字共37页下载文档
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GEO (Gene Expression Omnibus)数据库简介;近几年来,随着分子生物学技术的发展,微阵列芯片技术已成为生物学研究最重要的实验之一,尤其是基因芯片的广泛应用,产生了海量的数据,为基因研究提供大量高通量数据资料。;基因芯片发展历程;基因芯片概述;基因芯片技术流程;基因芯片技术流程;基因芯片检测结果;什么是GEO数据库;GEO数据库的构成;平台(Platform);平台(Platform);样本(Sample);样本(Sample);系列(Series);系列(Series);数据集组(DataSets);表达谱(Profiles);数据集组和表达谱的关系;GEO数据的数据检索——方法;GEO数据的数据检索——方法;GEO数据的数据检索——关键词;GEO数据的数据检索——关键词;GEO数据的处理;Find genes: Find gene name or symbol:直接查找数据集组中该基因的基因表达谱。 Find genes that are up/down for this condition(s) :可以根据选择的实验筛选条件,来找到一系列随该筛选条件???较明显表达差异的基因表达谱。;基因表达谱图;数据分析工具2;数据分析工具3;数据分析工具3;数据分析工具4;GEO BLAST;GEO2R工具;基因芯片数据分析软件;利用GEO2R比较同一系列中不同样本中的基因表达量差异;利用GEO2R求对比组的各样本中基因表达值在样本中的分布状况。(包括箱线图和可供导出的数值);通过输入实验平台的某个指针项目ID,可以直接检索到该指针对应的基因在不同样本中的表达谱图。;GEO2R程序在R平台上运行;Thanks
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