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两样本问题中差异表达基因的筛选研究的开题报告

一、研究背景

差异表达基因分析是研究生物学功能及其与疾病关系的重要手段之一，通过筛选和分析差异表达基因能够帮助我们深入了解生物学过程并发现疾病的潜在影响因素。对于不同垂直组织或疾病组织之间的差异分析，是基础研究的常见工作之一。

二、研究目的

本研究旨在基于两组样本数据，进行差异表达基因的筛选和分析。通过RNA测序技术，对控制组和实验组的基因表达水平进行比较，从而寻找最具有代表性的差异表达基因，并进一步进行生物信息学分析。

三、研究内容与方法

1.研究内容

本研究将选取两组样本进行差异表达基因分析，并将针对筛选出的差异表达基因进行生物信息学分析，包括富集分析、功能富集分析、基因互作网络等。

2.研究方法

（1）样本采集：选取对比组及实验组组织或血液样本并进行RNA抽提。

（2）RNA测序：构建样本文库，采用高通量测序技术对两组样本的RNA进行分析。

（3）差异表达基因筛选：使用DESeq2、Edger等差异分析软件筛选差异表达基因。

（4）生物信息学分析：对筛选出来的差异表达基因进行通路分析、功能分析、蛋白质互作网络分析等来挖掘其在细胞生物学过程中的作用。

四、研究意义

本研究将有助于深入了解生物学过程中基因表达调控的机制，为探究各种生物学过程和疾病的潜在影响因素提供基础数据支持。同时，本研究将为临床医学提供新的诊断和治疗策略的重要参考依据。

五、预期成果

本研究将获得两组样本差异表达基因数据，通过生物信息学分析，得出富集通路、功能富集、互作网络等重要基因信息，为探索差异表达基因在相关生物过程中的作用机制提供理论基础。

六、研究期限

本研究计划于2021年9月开始，至2022年6月完成。

七、团队组成

本研究由负责人和若干研究人员组成，团队成员需要熟练掌握生物信息学分析、高通量测序技术和统计学方法等专业知识，有生物医学、生物信息学等相关专业背景者优先。团队整合多方资源，共同完成研究任务。

八、研究预算

本研究将需要耗费材料费等预算，预计为10万元左右。

九、研究进展与安排

截至目前，我们已完成选题、研究方案的制定、实验室准备等工作，将根据时间安排和实际进展完成研究任务，并按时提交结论。