HPC高性能计算平台Linpack测试手册_以太网络.pdf
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Linpack 测试手册(1)
千兆以太网:
Step1:安装 MPICH2
将 MPICH2 安装包放到/hpc 目录下,运行:
tar –xvf mpich2-1.0.2p1.tar
cd mpich2-1.0.2p1
创建 MPICH2 安装目录:
mkdir /hpc/mpich2
设置 MPICH2 安装目录:
./configure --prefix=/hpc/mpich2
配置完成
make
make install
安装完成后退出当前目录
进入/root 目录编辑环境变量文件
cd /root
vi .bashrc
在文件最后附加一行
PATH=$PATH:/hpc/mpich2/bin
关闭并保存文件,执行命令:
source .bashrc
检查
which mpirun
返回/hpc/mpich2/bin/mpirun 则 mpi 安装正常。
下面进行通用作业启动机制配置:
修改/root/.mpd.conf 文件,内容为 secretword=myword
cd /root
#vi .mpd.conf
文件内容如下
SECRETWORD=123456
设置文件读取权限和修改时间
#touch /root/.mpd.conf
#chmod 600 /root/.mpd.conf
cp ./.mpd.conf /etc/mpd.conf
创建主机名称集合文件/root/mpd.hosts
#vi mpd.hosts
文件内容如下:
cn01
cn02
cn03
。。。。。。
启动 MPD 进程:命令如下
mpd (单节点启动)
或者通过 mpdboot 启动,命令如下
mpdboot –n 16 –f /root/mpd.hosts (16 为起动的机器的个数)
观看启动机器:
mpdtrace (看到所有启动机器的列表则正常)
退出用命令:
mpdallexit
Step2:安装数学库(GotoBLAS )
将数学库安装包 GotoBLAS-1.26.tar.gz 放到/hpc 目录下,运行:
tar –zxvf GotoBLAS-1.26.tar.gz
cd GotoBLAS
32 bit 安裝: ./quickbuild.32bit
64 bit 安裝: ./quickbuild.64bit
安裝完成后,在当前目录下会生成 3 个文件,系統根据你的 CPU 型式來取
名,例如:
libgoto.a
libgoto_core2p-r1.14.a 系統根据你的 CPU 型式來取名
libgoto_core2p-r1.14.so
其中 libgoto.a
即为使用的数学库函数,记下该路径
Step3:安装 linpack 测试包(hpl.tgz)
将 linpack 测试包 hpl.tgz 放到/hpc 目录下,运行
tar –xvf hpl.tgz
cd hpl
cd setup
cp ./Make.Linux_PII_FBLAS /hpc/hpl/Make.test
cd ..
pwd
目录为/hp
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