甘蓝型油菜和水稻黄单胞菌中小分子RNA的鉴定及功能分析的开题报告.docx

甘蓝型油菜和水稻黄单胞菌中小分子RNA的鉴定及功能分析的开题报告

一、研究背景和意义：

小分子RNA（SmallRNA）是存在于真核生物细胞中的一类长度在20-30nt之间的小分子非编码RNA。在生物过程中具有重要的调控作用，可以调控基因表达、蛋白翻译、转录后调控以及DNA甲基化等细胞过程。因此，在研究生物过程、生物学特性以及生物免疫、植物种植等方面均具有广泛的应用前景。

甘蓝型油菜和水稻黄单胞菌是两种重要的农业作物，其中甘蓝型油菜是我国大面积种植的油菜品种之一，而水稻黄单胞菌病是水稻生长中的重要病害之一，能够直接影响水稻的产量和品质，严重影响我国的水稻种植业。因此，对于这两种作物中小分子RNA的鉴定和功能分析具有重要的意义。

二、研究内容和方法：

本研究旨在鉴定甘蓝型油菜和水稻黄单胞菌中的小分子RNA，并进一步研究其在生物过程中的作用机制。具体方法如下：

1.RNA提取：采用TRIzol法对甘蓝型油菜和水稻黄单胞菌的样品进行RNA提取。

2.构建小分子RNA文库：将提取的RNA进行大小分选，筛选出20-30nt的小分子RNA，并制备文库。

3.测序和基因组比对：利用IlluminaHiSeq高通量测序技术测序得到文库中的小分子RNA序列，并进行基因组比对。

4.水稻黄单胞菌中小分子RNA的分析：将分析过后的小分子RNA在水稻黄单胞菌中的功能及调控机制进行研究。

5.甘蓝型油菜中小分子RNA的分析：将分析过后的小分子RNA在甘蓝型油菜中的功能及调控机制进行研究。

三、预期结果：

1.甘蓝型油菜和水稻黄单胞菌中小分子RNA的鉴定和对比分析。

2.分析小分子RNA在甘蓝型油菜和水稻黄单胞菌中的功能和调控机制，探究其与生物过程的关系。

3.为深入探究甘蓝型油菜和水稻黄单胞菌病机理，提供新思路和基础研究成果。

四、研究意义：

1.为进一步研究甘蓝型油菜和水稻黄单胞菌的种植、生长及治理提供新思路和方向。

2.增进对小分子RNA在生物过程中的调控作用的理解，进一步推进现代分子生物学和生物技术的发展。

3.为非编码RNA在生物学中的研究提供新的成果和实验基础。