SM22α敲除小鼠血管转录组学分析及差显基因的功能验证的开题报告.docx

SM22α敲除小鼠血管转录组学分析及差显基因的功能验证的开题报告

第一部分：研究背景和意义

SM22α是一种特异的血管平滑肌细胞标志物，其编码基因SM22α在血管平滑肌细胞中高表达。SM22α的发现对于研究血管平滑肌细胞的分化、功能以及生长调控等方面具有重要的意义。SM22α基因敲除小鼠是一种常用的实验动物模型，其可以用来研究SM22α的生物学功能。

本研究旨在通过SM22α基因敲除小鼠血管转录组学分析，探究SM22α基因敲除对血管平滑肌细胞的整体基因表达水平和调控机制的影响，并进一步验证SM22α基因敲除对差显基因的功能影响。

第二部分：研究内容和方法

1.动物模型的制备

本研究使用SM22α基因敲除小鼠作为研究模型，并以野生型小鼠为对照组。实验动物经过建立后，采用RT-PCR和Westernblotting验证SM22α基因的敲除效果。

2.转录组学分析

将采集到的小鼠主动脉和肺动脉组织分别进行RNA提取，将RNA库建立后利用高通量测序技术进行转录组学分析，获得基因表达水平的大量信息并进一步研究SM22α在小鼠血管平滑肌细胞中的调控机制。借助生物信息学方法，判断差异表达基因，进行GeneOntology分析和通路分析。

3.差显基因的功能验证

本研究筛选出与SM22α敲除相关的差异表达基因，使用siRNA或Crispr-Cas9技术沉默或敲除目标基因，观察沉默或敲除后的小鼠血管平滑肌细胞在细胞增殖、迁移、侵袭及钙信号等方面的差异，验证这些差异基因在SM22α敲除对血管平滑肌细胞的影响中的具体作用。

第三部分：研究预期结果和意义

预计本研究可以获取与SM22α基因敲除相关的差异表达基因信息，探究SM22α基因的生物学功能，并揭示其在血管平滑肌肿瘤及其它疾病的发生发展中的作用。这项工作有望为研究血管平滑肌细胞的分化和疾病机理提供新的思路和方法，同时也为开发相关疾病的治疗方法提供新的目标。